16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1055A


 
Base Pair (1055 : 1202)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.1* 62.7* -- -- 15.0 -- 21.9 -- -- -- -- -- -- -- 0.3 6909
3 -- -- -- 74.7 -- -- 0.1 -- 25.0 -- -- -- -- -- -- -- 0.1 5599
B -- -- -- 95.0 -- -- -- -- 4.8 -- -- -- -- -- -- -- 0.1 4398
A -- -- -- -- -- -- 1.0 -- 99.0 -- -- -- -- -- -- -- -- 198
C -- -- -- 46.6 -- -- 1.2 -- 52.1 -- -- -- -- -- -- -- -- 163
E -- -- -- -- -- -- -- -- 99.7 -- -- -- -- 0.1 -- -- 0.2 999
M -- -- 0.4 6.2 0.1* -- 90.5* 0.1 2.0 -- -- -- 0.1 -- -- -- 0.6 1152
 
Base Pair (1056 : 1201)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 2.2* 53.7* -- -- 0.3 -- -- -- 15.2 0.2 -- -- -- 14.2 14.0 0.2 6914
3 -- -- 63.0* -- -- 0.1 -- -- -- 2.7 0.2* -- -- -- 16.9 17.0 0.1 5605
B -- -- 76.2* -- -- 0.1 -- -- -- 3.5 0.2* -- -- -- 19.7 0.2 -- 4406
A -- -- 79.5 -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- 20.0 -- -- 195
C -- -- 92.0 -- -- 1.2 -- -- -- 0.6 -- -- -- -- 1.8 4.3 -- 163
E -- -- 1.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 3.8 94.5 0.2 1000
M -- 13.4 3.0 -- 0.1* 1.0 0.1 -- -- 78.5* 0.3 -- -- -- 2.8* 0.7 0.1 1151
 
Base Pair (1057 : 1200)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 83.9 -- -- -- 0.1 -- -- 0.1 -- -- 14.8 -- 0.3 -- 0.5 -- 0.2 6840
3 99.4 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.2 -- 0.1 -- 0.1 5530
B 99.5 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.3 -- -- -- -- 4328
A 99.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- 198
C 99.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- -- 163
E 99.5 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- 0.3 1000
M 6.7 0.1 -- -- 0.3 -- -- 0.2 -- -- 88.7* 0.1 0.6* 0.1 3.0 0.1* 0.2 1152


Last generated: Tue Oct 12 14:20:58 1999