16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1072


 
Base Pair (1072 : 1085)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 1.0 83.4* -- 0.1* -- -- -- -- -- 0.1 0.1 -- 0.1 15.2 7011
3 -- -- -- 0.7 98.8* -- 0.1* -- -- -- -- -- -- 0.1 -- 0.1 0.1 5699
B -- -- -- -- 99.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 -- 4484
A -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 198
C -- -- -- -- 98.2 -- -- -- -- -- -- -- 1.8 -- -- -- -- 164
E -- -- -- 3.9 94.9* -- 0.4* -- -- -- -- -- -- 0.4 -- 0.3 0.1 1013
M -- -- -- 2.3 4.9* -- 0.1 -- 0.3* -- -- 0.1 -- -- -- -- 92.3 1153
 
Base Pair (1073 : 1084)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.7 -- -- 82.6 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 0.7 15.8 7011
3 -- -- 0.8 -- -- 98.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 1.0 5699
B -- -- -- -- -- 99.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 4484
A -- -- 21.2 -- -- 78.3* -- -- -- 0.5* -- -- -- -- -- -- -- 198
C -- -- 3.0 -- -- 96.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- 164
E -- 0.2 -- -- -- 94.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 5.0 1013
M -- 0.1 -- 0.1 -- 3.6 -- -- -- 0.1* -- 0.2 -- -- 0.3 4.0* 91.7 1153


Last generated: Tue Oct 12 14:20:58 1999