16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1117


 
Base Pair (1117 : 1183)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.5 -- 0.7* 23.7 44.8* 0.1 2.2 3.2* 0.3 -- -- 0.5 2.3 0.8 0.4 2.4 16.0 6958
3 3.0 -- 0.5* 28.9 52.7* 0.2 2.4 3.8* 0.4 -- -- 0.6 2.7 0.9 0.5 2.8 0.5 5647
B 3.5 -- -- 30.4 56.7* -- 1.0 4.8* 0.1 -- -- 0.2 0.8 0.2 0.5 1.7 0.1 4432
A -- -- 0.5 1.0* 14.8 -- 37.8 -- 0.5 -- -- -- 40.8* 2.6 -- -- 2.0 196
C 0.6 -- 1.2 6.7 70.9* -- 5.5* 5.5 -- -- -- -- 2.4 0.6 -- 6.1 0.6 165
E 1.4 0.1 2.7* 27.8 42.9* 0.9 1.9 0.3 1.5* -- -- 2.6 3.6 3.6 0.7 8.1 2.0 1014
M 0.2 -- 1.4* 0.7 1.9* -- 0.3 -- 0.1* 0.1 0.1* -- 0.2 0.5 0.1 0.2 94.4 1151


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