16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1126


 
Base Pair (1126 : 1146)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1* -- 66.0* -- -- 0.1 1.1 -- -- -- -- 0.1* 0.1 -- 0.3 0.7 31.5 7059
3 -- -- 78.6* -- -- 0.1 1.2 -- -- -- -- 0.1* -- -- 0.3 0.6 19.1 5748
B -- -- 95.8* -- -- 0.1 1.6 -- -- -- -- 0.1* -- -- 0.3 0.7 1.4 4519
A -- -- 94.9 -- -- 2.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5 2.6 196
C 2.4* -- 72.6* 1.2* -- 1.2 -- -- -- -- -- -- 1.8 -- 3.0 7.3 10.4 164
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1028
M -- -- 2.2 -- -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- -- 0.1 0.3 96.9 1152
 
Base Pair (1127 : 1145)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 29.3* -- 0.1 0.8 1.5 0.2 0.6 1.8 4.6* 0.1* -- -- 14.4 15.1 -- 0.1* 31.5 7055
3 35.2* -- 0.1 0.7 1.7 0.1 0.7 2.2 5.6* 0.1* -- -- 16.2 18.3 -- -- 19.1 5743
B 42.8* -- 0.1 0.8 1.1 0.2 0.8 2.3 7.1* 0.1* -- -- 20.7 22.8 -- -- 1.3 4512
A 47.0* -- -- 4.5* 22.2 -- -- 11.1 -- -- -- -- -- 12.1 -- 0.5 2.5 198
C 12.7 0.6 0.6 5.5* 5.5 4.2* 0.6 0.6 1.2 -- -- -- 47.9* 6.7 -- 1.2 12.7 165
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1028
M 1.7* -- 0.1 0.3 -- -- 0.4* -- -- 0.1 -- -- 0.3 -- -- 0.3* 96.8 1152
 

 
Base Pair (1135 : 1139)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.7 0.5 0.5 0.9* 35.5* 0.3 -- 0.4 0.4* -- 0.7 0.4 0.5 0.1 20.8 38.2 7104
3 -- 0.8 0.5 0.4 1.1* 42.8* 0.1 -- 0.4 0.4* 0.1 0.9 0.3 0.6 0.1 25.2 26.4 5793
B -- 1.0 0.6 0.5 1.4* 54.4* 0.1 -- 0.5 0.3* -- 0.7 0.4 0.8 0.1 31.9 7.4 4563
A -- -- -- -- -- 0.5 -- -- -- 6.6 1.5 10.2* -- -- 0.5* 1.0 79.6 196
C -- 3.0 4.9 8.5* 0.6 25.6* 6.1 -- 0.6 0.6 -- 0.6 6.7* 0.6 -- 12.2 29.9 164
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1029
M -- -- 0.1 -- -- 0.1* 0.3* 0.2 -- -- -- -- 0.1 -- -- -- 99.3 1152


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