Base Pair (1179 : 1212) | Collective Score | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 0.2 | -- | 1.9 | 69.8* | 0.3 | -- | 14.5 | 2.2 | 1.7 | 0.6 | 1.1* | 2.5 | 2.8* | -- | 0.4 | 1.2 | 0.8 | 7079 |
3 | -- | -- | 0.1 | 78.4* | -- | -- | 16.0 | 0.4 | 2.0 | -- | -- | -- | 2.8* | -- | -- | -- | 0.2 | 5765 |
B | -- | -- | -- | 99.2 | -- | -- | 0.2 | 0.1 | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 4547 |
A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.0 | 197 |
C | -- | -- | -- | 96.4 | -- | -- | 0.6 | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.8 | 0.6 | 167 |
E | -- | -- | 0.5 | 0.9 | -- | -- | 70.8 | 2.0 | 9.6 | -- | -- | -- | 15.9 | -- | -- | -- | 0.4 | 1015 |
M | 1.4 | 0.1 | 11.1* | 22.2* | 1.6 | 0.1 | 9.2 | 11.6 | 0.4 | 3.9 | 7.1* | 15.0 | 3.2 | 0.3* | 2.2 | 7.1 | 3.6 | 1153 |
Base Pair (1180 : 1211) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 0.1 | 0.3 | -- | 78.7* | 0.9 | 0.1 | 2.7 | 0.7 | 3.7 | 2.7 | 5.1* | 1.6 | 0.1 | 0.5* | 0.2 | 0.5 | 2.0 | 7088 |
3 | -- | -- | -- | 92.4* | 1.0 | -- | 2.3 | 0.4 | 3.4 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 0.2* | -- | -- | 0.2 | 5774 |
B | -- | -- | -- | 98.8 | 0.4 | -- | 0.7 | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4569 |
A | -- | -- | -- | 3.6 | -- | -- | -- | -- | 93.3 | -- | -- | -- | -- | 3.1 | -- | -- | -- | 195 |
C | -- | -- | -- | 96.4 | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 1.2 | 167 |
E | -- | -- | -- | 81.3* | 3.9 | -- | 9.6 | 2.5 | 0.8 | -- | -- | 0.4 | 0.4* | 0.4 | 0.1* | -- | 0.7 | 1004 |
M | 0.4 | 2.1 | 0.2* | 6.5* | 0.3 | 0.5 | 5.6 | 2.1 | 6.2 | 16.6 | 31.6* | 9.4 | 0.1 | 2.3* | 1.2 | 3.9 | 11.2 | 1153 |
Base Pair (1181 : 1210) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 65.4* | -- | -- | 0.7* | 16.9 | -- | -- | 0.5 | -- | -- | 0.7 | 0.1 | -- | 0.1 | 0.3 | 0.6 | 14.6 | 7059 |
3 | 77.2* | -- | -- | 0.8* | 20.5 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 0.8 | 5745 |
B | 93.1 | -- | -- | -- | 5.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.9 | 4538 |
A | 99.0 | -- | -- | -- | 0.5 | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 193 |
C | 89.2 | -- | -- | -- | 6.6 | -- | -- | 3.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 167 |
E | 1.8 | -- | -- | 4.5 | 90.5* | -- | -- | 1.7* | -- | -- | -- | 0.5 | -- | 0.2 | -- | 0.8 | 0.1 | 1008 |
M | 3.0 | -- | 0.1 | 0.5 | 0.3 | -- | 0.1* | 1.3 | -- | -- | 3.9* | 0.1 | 0.1 | -- | 1.6 | 3.2* | 85.8 | 1153 |
Base Pair (1182 : 1209) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 69.4* | 0.2* | -- | -- | 1.0 | -- | -- | 4.2 | -- | -- | 3.1 | -- | -- | 0.1 | 6.5 | -- | 15.5 | 7127 |
3 | 81.7 | -- | -- | -- | 1.1 | -- | -- | 4.4 | -- | -- | 3.8 | -- | -- | 0.1 | 7.9 | -- | 0.9 | 5813 |
B | 97.7 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.6 | 4598 |
A | 97.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | 0.5 | -- | -- | 198 |
C | 95.2 | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | 3.6 | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 167 |
E | 6.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 24.9 | -- | -- | 21.8 | -- | -- | -- | 45.0 | -- | 1.9 | 1011 |
M | 2.9 | 1.0* | -- | 0.1 | 0.1* | 0.1 | -- | 3.2* | 0.1 | 0.3 | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 0.4 | -- | 91.8 | 1153 |
Base Pair (1187 : 1203) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 67.3* | 3.9 | -- | 0.4 | 14.0 | 3.9 | 0.2 | 0.1 | 6.4* | 0.3* | -- | -- | 2.7 | 0.4 | -- | -- | 0.4 | 7054 |
3 | 79.0* | -- | -- | 0.3* | 16.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 3.3 | 0.2 | -- | -- | 0.3 | 5740 |
B | 98.6 | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.2 | 4519 |
A | 38.2 | -- | -- | -- | 61.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 199 |
C | 93.4 | -- | -- | -- | 6.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 167 |
E | 0.2 | -- | -- | 2.0 | 78.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 18.3 | -- | -- | 0.2 | 0.2 | 1016 |
M | 5.1* | 23.9 | 0.3 | 0.5 | 1.4 | 24.2 | 1.0 | 0.5 | 39.5* | 1.6* | 0.1 | -- | 0.1 | 1.0 | -- | -- | 1.0 | 1153 |
Base Pair (1188 : 1202) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | -- | -- | 0.4* | 62.8* | 0.1 | 0.2 | 13.8 | -- | 5.7 | 0.3 | -- | 0.1 | 0.1 | 13.7* | -- | 0.1 | 2.7 | 7131 |
3 | -- | 0.1 | -- | 74.7* | 0.1 | 0.2 | 0.1 | -- | 5.1 | -- | -- | -- | -- | 16.8* | -- | 0.1 | 3.0 | 5817 |
B | -- | -- | -- | 94.4 | 0.1 | -- | 0.1 | -- | 5.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 4599 |
A | -- | -- | -- | -- | -- | 1.0 | 0.5* | -- | 11.2 | -- | -- | -- | 0.5 | 86.8* | -- | -- | -- | 197 |
C | -- | -- | -- | 45.5 | -- | -- | 1.2 | -- | 53.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 167 |
E | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | -- | 79.0 | -- | -- | 16.7 | 1015 |
M | -- | -- | 2.8 | 5.2 | 0.2 | 0.2* | 85.4* | -- | 1.9 | 1.6 | 0.1 | 0.3* | 0.8 | -- | -- | 0.3 | 1.2 | 1153 |
Base Pair (1189 : 1201) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 0.1 | 0.1 | 40.6* | 0.1 | -- | 0.2 | 10.7 | 0.2* | 1.0 | 16.5 | 0.7 | 13.5* | 1.0 | 1.2* | 13.8 | 0.1 | 0.2 | 7168 |
3 | 0.1 | -- | 46.1* | -- | -- | 0.1 | -- | 0.2* | -- | 19.7 | 0.8 | 16.5* | -- | -- | 16.3 | 0.1 | 0.1 | 5854 |
B | 0.1 | -- | 57.9* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 21.3 | 0.3* | -- | -- | -- | 20.1 | 0.2 | -- | 4658 |
A | -- | 0.6 | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.9 | 16.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 175 |
C | -- | -- | 80.8* | 2.4* | -- | 1.2 | 1.2 | 1.8 | -- | 10.2 | -- | 1.8 | 0.6 | -- | -- | -- | -- | 167 |
E | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | 1.4 | 0.8 | 94.7* | -- | -- | 1.8* | -- | 0.1 | 1015 |
M | 0.1 | 0.3 | 6.9 | -- | 0.2 | 0.6 | 67.2* | -- | 6.0 | 1.0 | 0.3 | -- | 6.2 | 7.5* | 2.7* | 0.3 | 0.7 | 1153 |
Base Pair (1190 : 1200) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | 68.2* | -- | -- | 0.1* | -- | -- | -- | 22.5 | -- | -- | 3.6 | -- | 0.2 | -- | 5.1 | -- | 0.3 | 7189 |
3 | 79.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17.3 | -- | -- | 1.4 | -- | 0.2 | -- | 1.4 | -- | 0.1 | 5875 |
B | 98.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.2 | -- | 0.3 | -- | 0.7 | -- | -- | 4654 |
A | 18.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 42.4 | -- | -- | 30.3 | -- | -- | -- | 9.1 | -- | -- | 198 |
C | 91.0* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6* | 4.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.6 | -- | -- | 167 |
E | 4.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 91.2 | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 3.3 | -- | 0.1 | 1017 |
M | 7.4 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 52.2* | 0.1 | 0.2* | 14.8 | -- | 0.2 | -- | 24.0 | 0.1* | 0.7 | 1153 |
Base Pair (1191 : 1199) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | -- | -- | -- | 98.7 | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.2 | 7205 |
3 | -- | -- | -- | 99.6 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 5891 |
B | -- | -- | -- | 99.7 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4671 |
A | -- | -- | -- | 99.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5 | -- | 197 |
C | -- | -- | -- | 99.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | 167 |
E | -- | -- | -- | 99.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 1017 |
M | -- | -- | -- | 94.2 | 0.2 | -- | 0.1 | 4.3 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.5 | 0.3 | 1153 |
Base Pair (1192 : 1198) | Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
T | -- | 55.3* | 0.4* | -- | -- | 14.8 | 0.3 | -- | 5.4 | 22.7 | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.7 | -- | -- | 0.2 | 7190 |
3 | -- | 53.4* | 0.2* | -- | -- | 17.3 | -- | -- | 0.5 | 27.6 | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.6 | -- | -- | 0.2 | 5879 |
B | -- | 62.2* | 0.1 | -- | -- | 2.0 | -- | -- | 0.1 | 34.8 | 0.1 | 0.1 | 0.1* | 0.4 | -- | -- | 0.1 | 4656 |
A | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 199 |
C | -- | 88.6* | 1.8* | -- | -- | 4.2 | -- | -- | 0.6 | 1.2 | -- | -- | -- | 3.6 | -- | -- | -- | 167 |
E | -- | 4.4 | 1.0 | -- | -- | 90.4 | -- | -- | 2.3 | -- | -- | -- | -- | 1.7 | 0.1 | -- | 0.2 | 1018 |
M | -- | 59.7* | 1.0 | -- | -- | 4.7 | 1.8* | -- | 31.0 | 0.8 | -- | 0.1 | 0.1 | 0.6 | -- | -- | 0.2 | 1150 |
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