16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 149


 
Base Pair (149 : 173)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.1 -- 84.5* 0.5 -- 1.1 0.8 1.3 0.1* -- 0.1 -- 0.1* -- 0.1 11.2 7098
3 -- 0.1 -- 95.8* 0.1 -- 1.0 0.9 1.4 0.1* -- 0.1 -- 0.1* -- -- 0.2 6107
B -- -- -- 96.6 -- -- 0.7 1.0 1.5 -- -- -- -- -- -- 0.1 0.2 4872
A -- -- -- 88.9 0.5 -- 8.3 0.5 0.5 -- -- 1.4 -- -- -- -- -- 217
C -- -- -- 85.1 1.8 -- 7.7 1.2 2.4 -- -- 0.6 -- -- -- 0.6 0.6 168
E -- 0.5 -- 93.7* 0.6 0.1 1.0 0.6 1.6 0.4* 0.3 0.2 -- 0.7* 0.2* -- 0.2 1018
M 0.1 0.1* 0.2 0.8 3.2* -- 0.2* -- 0.1 -- -- -- -- -- 0.1* 0.1 94.8 832
 
Base Pair (150 : 172)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 76.2 -- -- 0.2 0.2 -- -- 11.7 -- -- -- -- -- 0.1 11.7 7096
3 -- -- 87.2 -- -- 0.2 0.1 -- -- 12.2 -- -- -- -- -- -- 0.2 6105
B -- -- 84.7 -- -- -- 0.1 -- -- 14.9 -- -- -- -- -- -- 0.2 4868
A -- -- 94.0 -- -- -- -- -- -- 6.0 -- -- -- -- -- -- -- 217
C -- -- 47.0 0.6* -- -- 1.8 -- -- 49.4* -- -- -- -- -- 0.6 0.6 168
E -- -- 97.6* -- -- 1.0 0.3 -- -- 0.7 -- 0.1* -- -- -- 0.1 0.2 1020
M 0.1* 0.1* 0.4 -- -- -- 0.4* -- -- -- -- -- 0.1 -- -- 0.1* 98.8 832


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