16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 243


 
Base Pair (243 : 283)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1* -- -- 55.9* 0.1 -- 0.1 42.4 -- -- -- 0.1 -- -- 0.1 0.2 0.9 7214
3 -- -- -- 61.3 0.1 -- 0.1 38.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 6222
B -- -- -- 74.0 0.2 -- 0.1 25.4 -- -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.1 4976
A -- -- -- 55.2 -- -- -- 44.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 221
C -- -- -- 98.8 -- -- -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 0.6 170
E 0.1 -- -- 0.6 -- -- 0.1 98.9 -- -- -- -- -- -- 0.2 -- 0.1 1025
M 1.0 0.1* 0.4 6.1 -- -- 0.1 82.3* -- -- 0.2 0.1 -- -- 0.1 1.7* 7.8 830
 
Base Pair (244 : 282)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 98.7* 0.1* -- 0.1 0.1 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- 0.1 0.8 7244
3 -- -- 99.7 -- -- 0.1 -- -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- 6250
B -- -- 99.6 -- -- 0.1 0.1 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- 5005
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 221
C -- -- 98.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.2 170
E -- -- 99.7 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.1 0.1 -- 1024
M -- 0.4* 90.4* 0.6* -- -- 0.5 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- 0.4 7.7 832
 
Base Pair (245 : 281)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 29.6 1.3 -- -- 54.6* 0.1 -- -- 10.8* 1.1 0.9 -- -- 0.3 0.3 0.8 7205
3 -- 27.6 1.3 -- -- 59.8* -- -- -- 8.8* 1.2 0.8 -- -- 0.3 0.2 -- 6212
B -- 25.2 0.4 -- -- 73.8* -- -- -- 0.1 -- 0.2* -- -- -- 0.2 0.1 4968
A -- 19.5* 26.4* -- -- 20.0 -- -- -- 20.0 0.5 4.5 -- -- 7.7 1.4 -- 220
C -- 0.6 2.4 -- -- 94.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.4 -- 170
E -- 41.0 0.3 -- -- 0.3* 0.1 -- -- 48.5* 6.9 2.8 -- -- -- -- -- 1024
M -- 49.9* 1.1* 0.4* -- 7.3 0.7 -- 0.1 28.2 1.2 2.0 -- -- 0.2 0.8 7.9 831


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