16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 293


 
Base Pair (293 : 307)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 19.8 1.4* 0.8* 11.2 38.5* 1.4 0.5 2.1* -- -- 1.3 1.5 7.9 0.6 0.1 2.2 10.6 7339
3 22.8 1.7* 0.8* 12.7 41.9* 1.6 0.6 2.5* -- -- 1.5 1.7 8.9 0.6 0.1 2.5 0.1 6310
B 27.8 -- 0.6* 15.1 37.4* -- 0.8 3.0* -- -- -- 0.4 11.1 0.8 0.1 2.8 0.1 5058
A -- 46.1* 8.3* -- -- 43.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.2 -- 228
C 6.6 -- -- 5.4 77.1* -- -- -- -- 1.2* -- -- 7.2 1.2 -- 1.2 -- 166
E 3.5 -- -- 3.6 73.2* -- -- 0.5 -- -- 9.1* 8.5 0.2 -- 0.4 0.8 0.2 1024
M 0.1 -- 1.3* 1.8 6.4* -- 0.2 -- -- -- 0.1* -- 0.6 -- -- -- 89.4 871
 
Base Pair (294 : 306)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 2.7* 36.8* 0.1 0.2* 3.0 11.9 -- 0.6 27.5 0.1 2.5 3.5 0.2 0.1 0.2 10.6 7354
3 -- 3.1* 39.8* -- 0.2* 3.4 13.2 -- 0.7 32.0 0.2 2.9 4.0 0.2 -- 0.2 0.1 6324
B -- 3.7* 46.8* -- 0.2* 4.1 3.4 -- 0.4 34.7 0.2 3.6 2.4 0.1 0.1 0.2 0.1 5069
A 0.4* 2.6* 51.3* -- 0.4 1.7 -- -- -- 38.3 -- -- 5.2 -- -- -- -- 230
C -- -- 94.0* -- -- 3.6 -- -- -- 1.2 -- 0.6* -- -- -- 0.6 -- 167
E -- 0.3 2.7 0.1 -- -- 64.6* -- 2.5 17.4 -- -- 11.5 0.7* -- -- 0.2 1025
M -- 0.1* 4.1 0.5 -- 0.2 4.5* -- -- -- -- -- 0.6 -- 0.1 0.3* 89.6 871
 
Base Pair (295 : 305)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 63.5* 0.2* 0.2* -- 5.6 0.1 -- 11.1 1.2 0.1 0.6 -- 6.4 -- 0.1 11.0 7256
3 -- 71.2* 0.1* 0.2* -- 5.5 0.1 -- 12.8 1.3 0.1 0.7 -- 7.4 -- 0.1 0.4 6226
B -- 89.0* -- -- -- 6.7 -- -- -- 1.5 0.1 0.7 -- 1.8 -- 0.1* 0.1 4970
A -- 4.8 1.7 -- 0.9 3.9 2.2* -- 6.9 2.2 -- 2.6* -- 72.7* 0.4* 1.7 -- 231
C -- 64.7* 1.2* -- -- 32.3 -- -- -- 1.2 -- 0.6 -- -- -- -- -- 167
E -- -- -- 1.4 -- 0.1 0.3 -- 76.1 -- -- -- -- 20.2 -- -- 2.0 1025
M -- 7.2* 0.7* 0.2* -- 0.6 -- -- 1.1 0.3 0.2 -- -- -- -- -- 89.6 871


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