16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 367


 
Base Pair (367 : 394)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 2.8 1.1 -- -- 94.7 -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.6 0.3 0.1 0.2 7180
3 -- 3.2 0.1 -- -- 95.3 -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.7 0.3 -- 0.2 6194
B -- 0.1 0.1 -- -- 98.7 -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.4 0.4 -- 0.1 4942
A -- 84.7 -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- 10.9 -- -- 2.2 229
C -- -- -- -- -- 98.8 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 0.6 -- 165
E -- 0.1 -- -- -- 99.8 -- -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- 1023
M -- 0.2 9.5 -- -- 89.0* 0.1 -- -- 0.1 -- -- 0.2* -- 0.2 0.1 0.4 829
 
Base Pair (368 : 393)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 95.7 -- -- 3.2 -- -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.6 0.2 0.2 7177
3 -- -- 95.4 -- -- 3.5 -- -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.7 0.2 0.1 6189
B -- -- 99.2 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.4 0.2 -- 4941
A -- -- 2.2 -- -- 84.3 -- -- -- -- -- -- -- -- 11.3 -- 2.2 230
C -- -- 98.2 -- -- 1.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 165
E -- -- 97.9 -- -- 1.9 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- 0.1 -- -- 1018
M -- -- 97.5* 0.1 -- 1.1 -- -- 0.1* -- -- -- -- -- -- 0.5 0.7 831


Last generated: Tue Oct 12 14:20:57 1999