16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 437


 
Base Pair (437 : 497) Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.1 11.7 -- -- 37.5* 0.2* -- 0.1 -- -- -- 0.2 0.1 0.9 21.4 27.6 6807
3 -- 0.1 13.5 -- -- 43.4* 0.2 -- 0.1 -- -- -- 0.3* 0.1 1.0 22.4 19.0 5817
B -- 0.1 16.9 -- -- 55.2* 0.2 -- 0.1 -- -- -- 0.3* 0.1 0.6 24.8 1.7 4573
A -- -- 7.9 -- -- 0.5 -- -- -- -- 0.5* -- -- -- 13.6 77.6* -- 214
C -- -- 2.5 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- 95.7 0.6 163
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1030
M -- 0.4 0.8 0.2 -- 3.4* 1.0* -- 0.2 0.2 -- -- -- 0.1 0.1 0.4 93.2 835
 

 
Base Pair (439 : 495)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.1* 71.5* 0.6* -- 0.2 0.7 -- -- 0.1 -- -- 0.1 -- -- 0.2 26.4 6951
3 -- -- 80.1* 0.6* -- 0.3 0.8 -- -- 0.1 -- -- 0.1 -- -- 0.1 17.9 5961
B -- -- 96.7* 0.8* -- 0.3 1.0 -- -- 0.1 -- -- 0.1 -- -- 0.1 0.8 4706
A -- -- 99.6 -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 225
C -- -- 98.8 -- -- -- 0.6 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- 163
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 1030
M -- 0.2* 3.6* 0.6* -- 0.2 -- -- 0.2 0.4 -- -- 0.1 -- -- 1.4 93.2 835


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