16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 516


 
Base Pair (516 : 535)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 85.1 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 14.5 0.1 6588
3 -- -- 82.7 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 17.0 0.1 5596
B -- -- 99.6 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 0.1 4388
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 208
C -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 169
E -- -- 5.1 0.1 0.1 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- 94.6 -- 1000
M -- -- 98.4 -- -- 0.4 0.2 -- -- -- -- -- 0.1 -- 0.2 0.4 0.2 831
 
Base Pair (517 : 534)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 5.3 -- -- 0.1 88.2 -- -- -- -- -- -- 0.1 1.3 4.7 -- 0.1 0.1 6601
3 2.5 -- -- 0.1 92.9 -- -- -- -- -- -- 0.1 0.6 3.7 -- 0.1 0.1 5607
B 1.2 -- -- -- 93.4 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 4.7 -- 0.1 0.1 4398
A 32.7 -- -- -- 61.1 -- -- -- -- -- -- -- 5.8 -- -- -- 0.5 208
C -- -- -- 0.6 62.1 -- -- -- -- -- -- -- 0.6 36.1 -- -- 0.6 169
E 2.1 -- -- 0.2 97.4 -- -- -- -- -- -- 0.1 0.2 -- -- -- -- 1001
M 25.9 -- -- -- 61.9* 0.2* 0.1* 0.1 -- -- -- 0.4 5.9 5.3 -- 0.1 -- 833


Last generated: Tue Oct 12 14:20:57 1999