16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 827


 
Base Pair (827 : 873) Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 79.9* -- -- -- 0.6 -- -- 5.6 -- 0.1* 0.3 -- 0.2 0.1 13.3 7246
3 -- -- 93.0 -- -- -- 0.5 -- -- 5.9 -- -- 0.4 -- -- 0.1 0.1 5992
B -- -- 95.5 -- -- -- -- -- -- 4.3 -- -- 0.1 -- -- -- 0.1 4742
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 231
C -- -- 98.2 -- -- -- -- -- -- 1.8 -- -- -- -- -- -- -- 165
E -- 0.1* 79.7* -- -- 0.1 2.8 -- -- 14.5 -- -- 2.1 -- 0.1 0.3 0.3 1018
M -- -- 4.7* 0.3 -- -- 1.0 0.1* -- 4.4 -- 0.4* 0.1 -- 1.0 0.3 87.8 1094
 
Base Pair (828 : 872) Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.5* 9.3 0.3 0.1* 0.3 68.1* 0.1 1.7 4.5 0.1 0.1 8.2 0.3 0.3* 0.1 6.0 7155
3 -- 0.2 9.9 -- 0.1 0.1 74.2* 0.1 1.4 3.7 -- 0.1* 9.3 0.2* -- -- 0.7 5898
B -- -- 11.8 -- -- -- 79.7 -- 0.3 3.2 -- -- 4.8 -- -- -- 0.1 4649
A -- -- 14.8 -- -- -- 77.4 -- -- 7.8 -- -- -- -- -- -- -- 230
C -- -- 2.4 0.6 -- -- 85.5 -- 0.6 5.5 -- -- 3.0 -- -- -- 2.4 165
E -- 1.2 0.4 0.2 0.5 0.4 50.9* 0.3 6.4 5.0 0.1 0.3* 31.7 1.4* -- 0.1 1.2 1018
M -- 2.1* 6.8 2.0 0.3* 1.6 32.5* 0.3 3.9 8.5 0.6 0.4 3.1 0.5 1.7* 0.4 35.3 1097


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