16S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 888


 
Base Pair (888 : 912)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 61.7* -- -- 4.2* 13.2 -- -- 10.9 -- -- 1.1 -- 0.1 0.5 5.0 3.0 0.3 6831
3 72.5* -- -- 4.8* 16.2 -- -- 1.9 -- -- -- -- 0.1 -- 1.4 2.7 0.4 5527
B 93.0* -- -- -- 0.2 -- -- 2.4 -- -- -- -- 0.1 -- 1.7 2.3* 0.3 4321
A 0.9* -- -- 54.9* 44.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 213
C 72.4* -- -- 0.6 1.8 -- -- 18.4 -- -- -- -- -- -- 5.5 1.2* -- 163
E -- -- -- 15.2 79.5* -- -- 0.1* -- -- -- -- 0.2 -- -- 5.0 -- 993
M 6.3 -- -- 1.7 0.5 0.1 -- 53.1* 0.1 -- 6.5 0.1 0.2 3.1* 23.3 4.5* 0.6 1146
 
Base Pair (889 : 911)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 95.1 0.1 -- 0.1 4.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 6829
3 -- -- -- 99.4 0.3 -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 5526
B -- -- -- 99.5 0.1 -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 4318
A -- -- -- 99.5 0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 214
C -- -- -- 99.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 163
E -- -- -- 99.8 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 994
M 0.1 -- -- 73.0* -- -- 0.2 25.9 0.1 -- -- -- -- 0.2* 0.1* 0.2 0.3 1145
 
Base Pair (890 : 910)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 81.9* 0.1 -- -- 0.3 -- -- 0.1 -- -- 15.1 0.1* 0.5 0.5 1.0 0.1 0.2 6873
3 96.0 -- -- -- 0.1 -- -- 0.3 -- -- 2.2 -- 0.5 0.6 0.4 -- 0.1 5563
B 96.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.7 -- -- 0.1 0.5 -- 0.1 4351
A 99.1 -- -- -- -- -- -- 0.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 217
C 93.9 -- -- -- 3.7 -- -- -- -- -- 1.2 -- -- -- 1.2 -- -- 163
E 94.2 -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- 0.1 -- 2.7 2.5 0.1 -- -- 995
M 11.3 0.3 0.2 0.2 0.8 -- -- 0.5 0.2* 0.2 79.3* 0.9 0.3* 0.1 4.2 1.2* 0.4 1152
 
Base Pair (891 : 909)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 99.4 -- -- 0.1 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 0.2 6871
3 -- -- 99.2 -- -- 0.1 0.2 -- -- -- -- -- 0.2 -- -- 0.1 0.1 5562
B -- -- 99.4 -- -- 0.1 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 0.2 4354
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 217
C -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 163
E -- -- 99.7 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- -- -- -- 0.2 -- 991
M -- -- 99.5 -- -- -- 0.3 -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.1 -- 0.1 1151


Last generated: Tue Oct 12 14:20:57 1999