| Base Pair (1047:1210) | Collective Score | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 80.2* | -- | -- | 1.7* | 17.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | 6840 |
| 3 | 77.6* | -- | -- | 1.2* | 20.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.9 | 5532 |
| B | 93.6* | -- | -- | 0.3* | 5.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.0 | 4341 |
| A | 99.5* | -- | -- | 0.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 193 |
| C | 92.6 | -- | -- | -- | 6.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 163 |
| E | 3.5 | -- | -- | 4.9 | 91.0* | 0.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.3 | 994 |
| M | 91.0* | -- | 0.3* | 5.2* | 3.1 | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.2 | 0.1 | 1150 |
| Base Pair (1048:1209) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 83.1* | 11.5* | 1.6* | 0.9* | 0.1 | 1.9 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.6 | 6897 |
| 3 | 98.0* | -- | -- | 1.0* | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.7 | 5588 |
| B | 97.6* | -- | -- | 1.3* | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.7 | 4392 |
| A | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | 99.4 | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 163 |
| E | 99.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.4 | 994 |
| M | 8.1* | 68.9* | 9.6* | 0.1* | 0.1 | 12.3 | -- | -- | -- | 0.4 | 0.2 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | -- | 0.1 | 1151 |
| Base Pair (1050:1208) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 82.9* | 0.1* | 15.1* | 0.3* | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | 0.1 | 0.1 | 0.1 | -- | 0.5 | 6785 |
| 3 | 98.5* | -- | -- | 0.1* | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 0.2 | 0.1 | -- | 0.4 | 5475 |
| B | 98.7 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 0.2 | 0.1 | -- | 0.4 | 4294 |
| A | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 197 |
| C | 96.9* | -- | -- | 1.2* | 1.2 | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 163 |
| E | 97.6* | -- | -- | 0.3* | 1.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 980 |
| M | 6.4* | 0.5* | 89.7* | 1.0* | 1.1 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.6 | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 0.1 | 0.3 | 1152 |
| Base Pair (1051:1207) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 53.1* | 31.8* | 0.3* | 11.7* | 0.2 | 1.8 | -- | 0.3 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | -- | 0.5 | 6871 |
| 3 | 58.3* | 38.4* | -- | 0.5* | 0.1 | 1.7 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.5 | 5561 |
| B | 47.7* | 48.9* | -- | 0.1* | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.4 | 4362 |
| A | 97.5 | -- | -- | -- | 0.5 | -- | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | 99.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 163 |
| E | 97.0* | -- | -- | 2.4* | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.3 | 997 |
| M | 21.8* | 4.3* | 1.9* | 67.2* | 0.7 | 2.3 | -- | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 0.1 | 0.1 | 1152 |
| Base Pair (1052:1206) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 0.2 | 0.7 | -- | -- | 95.9* | -- | -- | 0.1 | 2.6* | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 0.3 | 6733 |
| 3 | -- | 0.2 | 0.2 | -- | -- | 99.2 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.3 | 5423 |
| B | -- | 0.1 | 0.2 | -- | -- | 99.3 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 4234 |
| A | -- | 1.6 | -- | -- | -- | 97.8 | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 186 |
| C | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 163 |
| E | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 99.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.4 | 999 |
| M | -- | 0.4 | 3.3 | -- | -- | 80.4* | 0.1 | -- | -- | 14.9* | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 0.4 | 0.3 | 1152 |
| Base Pair (1053:1205) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 2.6 | -- | -- | 15.1 | 81.7* | -- | -- | 0.1* | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 6891 |
| 3 | 3.0 | -- | -- | 0.1 | 96.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 5581 |
| B | 3.8 | -- | -- | -- | 95.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 4383 |
| A | 1.0 | -- | -- | 0.5 | 98.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 197 |
| C | 0.6 | -- | -- | -- | 99.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 163 |
| E | -- | -- | -- | -- | 99.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 997 |
| M | 0.5* | -- | -- | 90.9* | 7.8 | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 1152 |
| Base Pair (1056:1204) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 15.0* | 82.0* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 6897 |
| 3 | -- | 0.2* | 96.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.5 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.2 | 5588 |
| B | -- | 0.3* | 96.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 4386 |
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | -- | 98.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | 163 |
| E | -- | -- | 99.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 1000 |
| M | 0.1* | 89.3* | 6.5* | 0.1* | -- | 0.9 | -- | -- | -- | 2.8 | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 1151 |
| Base Pair (1057:1203) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 66.6* | 14.9* | 0.5* | -- | 14.9 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 2.5 | 0.1 | 0.1 | -- | 0.2 | 6802 |
| 3 | 78.5 | -- | -- | -- | 17.8 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 3.2 | 0.2 | -- | -- | 0.2 | 5492 |
| B | 98.6 | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.2 | -- | -- | 0.1 | 4291 |
| A | 37.9 | -- | -- | -- | 61.6* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | 93.3 | -- | -- | -- | 6.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 163 |
| E | 0.2 | -- | -- | 0.1 | 82.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17.0 | -- | -- | 0.1 | 0.3 | 999 |
| M | 5.7* | 88.7* | 2.8* | 0.2* | 2.1 | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | 0.2 | 1152 |
| Base Pair (1058:1199) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 0.7 | -- | -- | 0.8 | 95.5* | -- | -- | 0.1* | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 2.4 | 0.3 | 6900 |
| 3 | 0.1 | -- | -- | -- | 99.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.2 | 5594 |
| B | 0.1 | -- | -- | -- | 99.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.1 | 0.2 | 4395 |
| A | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 195 |
| C | -- | -- | -- | -- | 99.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 161 |
| E | -- | -- | -- | -- | 99.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 1000 |
| M | 3.7 | -- | -- | 4.6 | 76.2* | -- | -- | 0.7* | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 14.7 | 0.1 | 1150 |
| Base Pair (1059:1198) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 75.6* | 23.5* | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | 6911 |
| 3 | -- | 70.9* | 28.2* | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 0.2 | 5602 |
| B | -- | 63.6* | 35.7* | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | 4398 |
| A | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | 96.9* | 2.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 163 |
| E | -- | 97.8* | 1.0* | -- | -- | 0.5 | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.3 | 1002 |
| M | -- | 96.0* | 3.6* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 1151 |
| Base Pair (1060:1197) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 34.1* | 65.3* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | 6845 |
| 3 | -- | 23.5* | 76.1* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 0.2 | 5535 |
| B | -- | 2.6* | 97.1* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4340 |
| A | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 197 |
| C | -- | -- | 98.8 | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 163 |
| E | -- | 99.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1* | 0.1 | -- | -- | 0.4 | 994 |
| M | -- | 90.1* | 8.4* | 0.1* | -- | 0.9 | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | 0.2 | -- | -- | 0.2 | 1152 |
| Base Pair (1061:1195) (Tertiary) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 91.4* | -- | -- | 6.3* | 1.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | 6774 |
| 3 | 97.0* | -- | -- | 0.3* | 2.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | 5466 |
| B | 99.4 | -- | -- | -- | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 4267 |
| A | 36.0 | -- | -- | 7.6 | 55.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.5 | 197 |
| C | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 162 |
| E | 99.3 | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.2 | 998 |
| M | 63.7* | -- | -- | 35.5* | 0.3 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.1 | -- | 0.2 | 1151 |
| Base Pair (1062:1194) (Tertiary) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 1.5* | 18.1 | 0.1 | -- | 1.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.1 | 77.9* | 0.2 | 6909 |
| 3 | -- | 1.8* | 17.5 | 0.1 | -- | 2.0 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 78.3* | 0.2 | 5600 |
| B | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | 99.5 | 0.1 | 4400 |
| A | -- | 37.9 | 9.1 | -- | -- | 52.5* | -- | -- | -- | 0.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.8 | 96.9 | -- | 163 |
| E | -- | 2.6* | 96.2* | -- | 0.1* | 0.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.2 | 0.2 | 998 |
| M | -- | 0.1 | 23.1 | 0.2 | -- | 0.6 | -- | -- | -- | 0.1* | -- | 1.7 | -- | -- | 0.3 | 73.6* | 0.4 | 1151 |
| Base Pair (1063:1193) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | -- | 84.1* | 14.6* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | 0.1 | -- | -- | -- | 0.7 | 0.1 | 6907 |
| 3 | -- | 81.8* | 17.8* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | 0.1 | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 5598 |
| B | -- | 99.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4397 |
| A | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | -- | 98.8* | 0.6* | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 163 |
| E | -- | 0.1* | 99.5* | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.2 | 999 |
| M | 0.1* | 93.0* | 1.2 | 0.2 | -- | 0.4 | 0.1* | -- | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.3 | -- | -- | 0.1 | 4.2* | 0.2 | 1151 |
| Base Pair (1064:1192) | Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| T | 73.2* | -- | 2.5* | 0.4 | 1.8 | 0.2 | 0.2 | 0.1 | 0.1* | 0.7 | 0.1 | 12.9* | 2.5 | 0.5 | 4.2 | 0.4 | 0.1 | 6914 |
| 3 | 79.8* | -- | 0.4* | -- | 1.8 | 0.2 | -- | 0.1 | 0.1* | -- | -- | 15.9* | 0.1 | 0.4 | 0.8 | 0.2 | 0.1 | 5606 |
| B | 97.1 | -- | -- | -- | 2.1 | -- | -- | 0.1 | -- | -- | -- | -- | 0.1 | 0.6 | -- | -- | -- | 4404 |
| A | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 198 |
| C | 89.6* | -- | -- | -- | 6.1 | -- | 0.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.7 | -- | -- | -- | 163 |
| E | -- | 0.1 | 2.2 | -- | 1.0 | 1.3 | -- | -- | 0.3* | 0.1 | 0.1 | 89.3* | -- | -- | 4.3* | 1.1 | 0.2 | 1000 |
| M | 38.0* | 0.1* | 12.9* | 3.0* | 1.0 | -- | 1.0 | 0.2 | 0.3 | 3.9 | 0.7 | -- | 15.0 | 0.3 | 21.7 | 1.6 | 0.5 | 1150 |