16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1068
| Base Pair (1068:1107)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
97.7* |
-- |
-- |
1.2* |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.3 | 6941 |
| 3 |
98.6* |
-- |
-- |
0.9* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5629 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4414 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
| C |
98.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 | 164 |
| E |
94.5* |
-- |
-- |
5.1* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1014 |
| M |
93.2* |
0.2* |
0.3* |
2.8* |
1.6 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.3 |
0.7 | 1153 |
| |
| Base Pair (1069:1106)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
80.8* |
13.1* |
0.7* |
0.1 |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.4 | 6944 |
| 3 |
-- |
80.3* |
14.3* |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 5633 |
| B |
-- |
98.6* |
0.9* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4418 |
| A |
-- |
77.7* |
1.0* |
-- |
-- |
20.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- | 197 |
| C |
-- |
93.9* |
3.0* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 164 |
| E |
-- |
1.4* |
75.7* |
-- |
-- |
22.6 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1014 |
| M |
0.3* |
80.7* |
8.7* |
4.9* |
0.5 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
0.4 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.3 |
0.9 | 1152 |
| |
| Base Pair (1070:1105)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
1.7* |
89.7* |
0.7* |
0.3 |
0.7 |
4.3 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 | 6933 |
| 3 |
0.3* |
0.4* |
98.3* |
0.1* |
0.3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5621 |
| B |
-- |
-- |
99.7 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4406 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
| C |
-- |
0.6* |
98.2* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 164 |
| E |
1.7* |
2.2* |
92.3* |
0.3* |
1.6 |
0.6 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 1014 |
| M |
0.1* |
8.5* |
46.0* |
4.8* |
0.3 |
3.0 |
25.4 |
-- |
0.1 |
7.1 |
0.3 |
0.2 |
2.6 |
0.1 |
-- |
1.0 |
0.6 | 1153 |
| |
| Base Pair (1071:1104)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
73.9* |
2.5 |
1.0 |
0.1 |
1.9 |
4.6* |
-- |
0.6 |
0.7 |
0.1 |
-- |
0.5 |
13.2 |
-- |
0.3* |
0.4 | 6904 |
| 3 |
0.1 |
82.6* |
-- |
0.1* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.6* |
16.2 |
-- |
-- |
0.3 | 5592 |
| B |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 4379 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 196 |
| C |
-- |
97.0* |
0.6* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 164 |
| E |
0.4 |
6.5 |
-- |
0.4* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
3.3 |
89.1* |
-- |
-- |
0.1 | 1013 |
| M |
0.3* |
27.9* |
15.2 |
5.9 |
0.6 |
11.1 |
27.7* |
0.3 |
3.2 |
3.8 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.3 |
-- |
2.7* |
0.7 | 1153 |
| |
| Base Pair (1072:1103)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
84.0* |
-- |
0.2* |
14.3* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.3 | 6949 |
| 3 |
98.7* |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 | 5637 |
| B |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 4423 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 196 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 164 |
| E |
94.8* |
-- |
-- |
0.8 |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.2 | 1014 |
| M |
8.9* |
0.2* |
1.4* |
85.9* |
1.2 |
0.1 |
-- |
0.6 |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.6 | 1153 |
| |
| Base Pair (1073:1102)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
13.9* |
85.1* |
0.1* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 | 6951 |
| 3 |
-- |
-- |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 5639 |
| B |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 4424 |
| A |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 164 |
| E |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1014 |
| M |
0.1* |
84.0* |
11.8* |
0.5* |
-- |
0.3 |
0.4 |
0.1 |
-- |
1.2 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.3 |
0.7 | 1153 |
| |
Last generated : Fri Jun 16 2000 (14 : 29)