16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1086
| Base Pair (1086:1099)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
4.1 |
1.8 |
0.2 |
0.1 |
61.6* |
0.2* |
-- |
0.2 |
6.5 |
-- |
8.3* |
-- |
-- |
0.3 |
0.6 |
15.9 | 6887 |
| 3 |
-- |
4.9 |
1.6 |
0.1 |
0.1 |
73.7* |
0.1* |
-- |
0.1 |
8.0 |
0.1 |
10.2* |
-- |
-- |
0.3 |
0.6 |
0.3 | 5575 |
| B |
-- |
0.1 |
1.7 |
0.2* |
-- |
94.0* |
-- |
-- |
0.2 |
2.6* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.1 | 4350 |
| A |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
| C |
-- |
2.4 |
3.0 |
0.6 |
-- |
81.1* |
5.5* |
-- |
4.3 |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
1.8 |
0.6 |
-- | 164 |
| E |
-- |
7.2 |
1.5 |
-- |
0.4 |
1.8* |
0.5* |
-- |
-- |
32.4 |
0.2 |
53.2* |
-- |
0.2 |
0.3 |
2.0 |
0.4 | 1024 |
| M |
0.1* |
-- |
2.7* |
0.8* |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.0 |
94.9 | 1153 |
| |
| Base Pair (1087:1098)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
61.4* |
3.7 |
0.7 |
2.4* |
0.4 |
13.0* |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.7 |
15.7 | 6968 |
| 3 |
73.2* |
4.6 |
0.7 |
2.7* |
0.3 |
16.0* |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
0.2 | 5656 |
| B |
93.1* |
1.4* |
0.4* |
3.4* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.2 | 4429 |
| A |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 198 |
| C |
83.5* |
-- |
1.8 |
3.7 |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
3.0 |
4.3* |
0.6 | 164 |
| E |
1.5* |
-- |
2.0 |
0.5* |
-- |
88.4* |
-- |
-- |
6.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
0.3 | 1025 |
| M |
0.2* |
-- |
0.7 |
0.6 |
0.8 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
2.2* |
94.6 | 1153 |
| |
| Base Pair (1088:1097)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
81.2* |
0.2* |
2.3* |
0.4* |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
15.1 | 6980 |
| 3 |
96.2* |
0.2* |
2.8* |
0.2* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 | 5668 |
| B |
99.5* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 4443 |
| A |
19.2* |
-- |
75.3* |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
88.4* |
-- |
-- |
6.7* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- | 164 |
| E |
97.0* |
0.5* |
0.6* |
-- |
0.3 |
0.5 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
0.3 | 1023 |
| M |
6.2* |
0.1* |
0.3* |
0.3* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.3 | 1153 |
| |
| Base Pair (1089:1096)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
80.9* |
2.3* |
-- |
0.5* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
15.4 | 6972 |
| 3 |
95.6* |
2.8* |
-- |
0.5* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.4 | 5660 |
| B |
97.8* |
1.2* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.4 | 4433 |
| A |
94.4* |
5.1* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
96.3* |
-- |
1.2* |
1.2* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 164 |
| E |
86.8* |
9.1* |
-- |
2.8* |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 | 1025 |
| M |
6.2* |
0.1 |
0.1* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
92.2 | 1153 |
| |
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