16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1113
Base Pair (1113:1187)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
3.9* |
81.8* |
3.0* |
3.9* |
-- |
2.3 |
1.6 |
0.1 |
-- |
2.4 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.4 | 6931 |
3 |
-- |
96.4* |
0.4* |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 5622 |
B |
-- |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4403 |
A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
C |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 163 |
E |
0.2* |
81.7* |
2.0* |
0.2* |
-- |
15.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 | 1018 |
M |
23.4* |
7.4* |
16.2* |
23.5* |
0.3 |
-- |
9.4 |
0.4 |
0.1 |
14.7 |
-- |
0.3 |
1.0 |
-- |
1.8 |
0.4 |
1.1 | 1151 |
|
Base Pair (1114:1186)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
5.9* |
71.5* |
10.9* |
6.3* |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.5 |
0.1 |
2.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
1.4 |
0.1 |
0.3 | 6978 |
3 |
0.3* |
83.7* |
12.4* |
0.1* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 5668 |
B |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4450 |
A |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
C |
-- |
98.2* |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 163 |
E |
1.7* |
11.6* |
69.0* |
0.5* |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
14.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.1 |
-- | 1016 |
M |
34.5* |
7.6* |
5.5* |
37.5* |
0.6 |
0.1 |
0.1 |
3.1 |
0.1 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
0.3 |
8.2 |
0.6 |
0.8 | 1152 |
|
Base Pair (1115:1185)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
5.5* |
22.2 |
13.6 |
3.8* |
-- |
52.3* |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
1.0* |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 | 7041 |
3 |
4.8* |
22.0 |
5.3 |
4.1* |
-- |
62.9* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.1 | 5731 |
B |
0.2* |
20.4 |
4.2 |
3.7* |
-- |
71.3* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4512 |
A |
41.9* |
32.3* |
1.0* |
22.7* |
1.0 |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
C |
-- |
3.6* |
75.8* |
2.4* |
-- |
15.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- | 165 |
E |
18.0* |
26.7 |
10.7 |
2.3* |
-- |
38.2* |
-- |
-- |
0.3 |
0.2* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
0.4 | 1016 |
M |
10.0* |
26.0* |
46.5* |
2.5* |
0.1 |
4.2 |
0.3 |
1.3 |
0.2 |
6.2 |
0.3 |
0.1 |
0.4 |
0.2 |
0.3 |
0.3 |
1.2 | 1150 |
|
Base Pair (1116:1184)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
3.1* |
20.1 |
2.4 |
8.1* |
1.5 |
47.5* |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
0.8* |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
14.8 | 6838 |
3 |
3.8* |
22.9 |
1.4 |
10.0* |
1.9 |
57.5* |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
1.0* |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 | 5526 |
B |
-- |
26.4 |
0.4 |
-- |
-- |
72.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4307 |
A |
-- |
46.7* |
5.1* |
-- |
-- |
17.8 |
1.0 |
-- |
-- |
28.4 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- | 197 |
C |
-- |
52.1* |
10.3* |
0.6* |
-- |
36.4 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 165 |
E |
20.6* |
3.9* |
5.3* |
54.1* |
9.9 |
1.0 |
1.0 |
0.4 |
1.0 |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.8 |
0.6 |
0.4 |
0.4 | 1017 |
M |
0.3* |
1.7* |
6.1* |
0.4* |
0.1 |
0.9 |
1.0 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
1.1 |
88.1 | 1152 |
|
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