16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 113
| Base Pair (113:314)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
81.3* |
17.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 6916 |
| 3 |
78.8* |
20.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 5931 |
| B |
99.0* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4720 |
| A |
-- |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 203 |
| C |
99.4* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 164 |
| E |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 | 1008 |
| M |
95.2* |
0.1* |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.1* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.6* |
3.2 | 830 |
| |
| Base Pair (114:313)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4* |
0.1* |
98.3* |
0.3* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.3 | 6906 |
| 3 |
0.5* |
0.1* |
98.6* |
0.3* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 5921 |
| B |
0.6* |
0.1* |
98.5* |
0.4* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4704 |
| A |
-- |
-- |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- | 204 |
| C |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 164 |
| E |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1013 |
| M |
-- |
0.5* |
94.7* |
0.2* |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.2 |
2.7 | 830 |
| |
| Base Pair (115:312)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
81.1* |
17.2* |
0.7* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 6856 |
| 3 |
78.5* |
20.1* |
0.8* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 5871 |
| B |
98.1* |
0.3* |
1.0* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4659 |
| A |
18.2* |
79.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 203 |
| C |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 164 |
| E |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 1009 |
| M |
94.9* |
-- |
0.4* |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
0.1 |
2.6 | 830 |
| |
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