16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1158
Base Pair (1158:1178)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
81.2* |
0.4* |
0.1* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.8 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
15.2 | 7138 |
3 |
-- |
96.4* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
2.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
0.2 | 5825 |
B |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4605 |
A |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 195 |
C |
-- |
91.0* |
-- |
0.6* |
-- |
3.0 |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6 | 167 |
E |
-- |
80.9* |
0.1 |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.8 |
12.7 |
0.7 |
-- |
0.2 |
1.2* |
0.1 |
0.5 | 1019 |
M |
0.1* |
2.5* |
2.3* |
0.3* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
93.5 | 1152 |
|
Base Pair (1159:1177)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
5.5 |
0.2 |
0.1 |
-- |
73.5* |
1.5* |
0.3 |
1.5 |
0.4 |
0.4* |
0.1 |
0.1 |
0.8 |
-- |
0.4 |
15.2 | 7135 |
3 |
-- |
6.6 |
0.2 |
0.1 |
-- |
87.0* |
1.8* |
0.4 |
1.8 |
0.4 |
-- |
0.1* |
0.1 |
0.9 |
0.1 |
0.4 |
0.3 | 5822 |
B |
-- |
5.7 |
0.1 |
-- |
-- |
93.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4600 |
A |
-- |
53.0* |
-- |
-- |
-- |
46.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
-- | 198 |
C |
-- |
3.0 |
0.6 |
0.6* |
-- |
90.4* |
-- |
-- |
1.2 |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
2.4 | 167 |
E |
0.1 |
1.6 |
0.7 |
0.4 |
-- |
65.6* |
10.1* |
2.2 |
8.0 |
2.3 |
0.2* |
0.2 |
0.4 |
5.1 |
0.3 |
2.3 |
0.7 | 1018 |
M |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.2* |
0.1 |
2.5* |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
2.0* |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
93.6 | 1152 |
|
Base Pair (1160:1176)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
3.6 |
0.5* |
2.2 |
4.4* |
0.3 |
0.1 |
0.7 |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
69.9* |
0.1 |
-- |
-- |
17.7 | 7109 |
3 |
3.9 |
0.6* |
2.5 |
5.3* |
0.3 |
0.1 |
0.7 |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
82.6* |
0.1 |
-- |
-- |
3.1 | 5796 |
B |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
99.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4571 |
A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 198 |
C |
-- |
1.2* |
4.2 |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
88.6* |
-- |
-- |
0.6* |
2.4 | 166 |
E |
22.2* |
3.2* |
13.6* |
30.2* |
1.3 |
0.4 |
3.6 |
2.0 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
5.9 |
0.1 |
0.1 |
-- |
16.8 | 1021 |
M |
2.3 |
-- |
0.3 |
0.3* |
0.3 |
0.1* |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
2.8* |
0.2 |
-- |
-- |
93.2 | 1153 |
|
Base Pair (1161:1175)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
2.0* |
72.3* |
7.8* |
0.5* |
-- |
0.6 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
16.0 | 7113 |
3 |
2.4* |
85.0* |
9.3* |
0.5* |
-- |
0.6 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.2 | 5799 |
B |
-- |
98.9 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 4581 |
A |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 194 |
C |
0.6* |
89.2* |
2.4* |
1.2* |
-- |
1.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.8 | 167 |
E |
13.8* |
20.5* |
52.8* |
2.6* |
0.2 |
2.9 |
0.1 |
0.5 |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
1.5 |
0.4 |
0.2 |
0.4 |
3.6 | 1018 |
M |
-- |
5.2* |
1.3* |
0.6* |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
92.2 | 1153 |
|
Base Pair (1162:1174)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
4.5* |
71.9* |
4.9* |
0.6* |
0.8 |
0.9 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
15.5 | 7114 |
3 |
5.5* |
85.0* |
5.6* |
0.6* |
1.0 |
0.8 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.6 | 5800 |
B |
-- |
97.2* |
1.3* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 | 4579 |
A |
-- |
88.8* |
9.1* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
C |
-- |
77.8* |
5.4* |
1.8* |
-- |
6.6 |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
4.8 | 167 |
E |
31.1* |
30.0* |
24.3* |
3.4* |
5.8 |
1.7 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.6 |
0.9 |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.2 |
1.5 | 1018 |
M |
0.2* |
4.4* |
1.6* |
0.2* |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
92.4 | 1153 |
|
Base Pair (1163:1173)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
61.1* |
5.1* |
6.7* |
9.2* |
1.0 |
0.8 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
15.4 | 7101 |
3 |
72.6* |
6.1* |
7.9* |
10.2* |
1.1 |
0.9 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.5 | 5787 |
B |
75.3* |
4.3* |
7.4* |
10.7* |
1.0 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 4571 |
A |
67.2* |
-- |
5.7* |
22.4* |
0.5 |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 192 |
C |
77.2* |
-- |
3.0* |
9.6* |
3.6 |
1.8 |
0.6 |
0.6 |
1.2 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 167 |
E |
61.9* |
15.7* |
10.3* |
5.8* |
1.5 |
2.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.3 |
1.5 | 1018 |
M |
0.3* |
0.4* |
1.6* |
4.2* |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
92.4 | 1153 |
|
Base Pair (1164:1172)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
52.6* |
4.4* |
2.5* |
4.5* |
17.7 |
2.0 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
15.3 | 7129 |
3 |
61.6* |
5.3* |
3.0* |
4.9* |
21.6 |
2.4 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 5815 |
B |
61.7* |
4.0* |
2.6* |
5.2* |
23.1 |
2.6 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4594 |
A |
46.4* |
31.1* |
9.7* |
3.6* |
8.7 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 196 |
C |
83.2* |
1.8 |
-- |
6.6* |
1.8 |
2.4* |
0.6 |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
0.6 | 167 |
E |
64.5* |
6.4* |
3.7* |
4.1* |
17.2 |
1.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.2 |
0.4 |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.9 | 1019 |
M |
2.4* |
0.2* |
0.4* |
1.9* |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
94.2 | 1153 |
|
Base Pair (1165:1171)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
19.0* |
18.5* |
31.7* |
1.3* |
0.2 |
12.7 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
15.9 | 7132 |
3 |
23.3* |
22.4* |
37.0* |
1.3* |
0.2 |
14.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.7 | 5819 |
B |
28.8* |
11.7* |
41.0* |
1.3* |
-- |
16.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 | 4598 |
A |
4.6* |
41.6* |
49.2* |
4.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
C |
-- |
5.4 |
41.6 |
0.6 |
-- |
45.2* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
3.6 | 166 |
E |
2.0* |
67.0* |
16.8* |
0.9* |
0.9 |
7.3 |
0.9 |
-- |
0.5 |
0.6 |
0.3 |
0.2 |
0.3 |
0.6 |
0.1 |
-- |
1.8 | 1018 |
M |
0.1* |
0.2* |
3.4* |
1.0* |
0.2 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.7 | 1153 |
|
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