16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 122
| Base Pair (122:239)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.9 |
-- |
1.2 |
8.9 |
35.7* |
0.1 |
4.7 |
5.0 |
26.2* |
0.1* |
0.5 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
7.6* |
-- |
0.5 | 6923 |
| 3 |
0.3 |
-- |
0.3 |
9.3 |
39.0* |
-- |
5.4 |
5.2 |
30.1* |
0.1* |
0.5 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
8.9* |
-- |
0.2 | 5935 |
| B |
0.3 |
-- |
-- |
11.5 |
49.1* |
-- |
0.7 |
4.1 |
33.6* |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 4717 |
| A |
-- |
-- |
-- |
4.4 |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
87.7* |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
2.0 |
-- |
-- |
-- | 204 |
| C |
0.6 |
-- |
-- |
18.5 |
56.0* |
-- |
-- |
11.3 |
13.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 168 |
| E |
0.8 |
-- |
1.9 |
-- |
0.2* |
-- |
28.0* |
10.6 |
2.2 |
0.7 |
3.2 |
-- |
0.6 |
0.1 |
51.8* |
-- |
0.1 | 1014 |
| M |
71.9* |
-- |
7.4* |
4.2* |
7.5 |
0.4 |
1.2 |
2.2 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
4.3 | 829 |
| |
| Base Pair (123:238)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
92.0* |
5.4* |
0.7* |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 6977 |
| 3 |
0.1 |
93.0* |
5.7* |
0.1 |
0.2* |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 | 5989 |
| B |
0.1 |
91.9* |
7.1* |
-- |
0.2* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 4769 |
| A |
-- |
99.5* |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 206 |
| C |
-- |
92.8* |
6.0* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
0.2* |
96.6* |
0.3* |
0.5* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 |
1.3 |
-- |
-- |
0.2 | 1014 |
| M |
0.5* |
84.0* |
2.8* |
4.7* |
0.5 |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
4.3 | 830 |
| |
| Base Pair (124:237) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
57.3* |
14.9* |
3.1* |
23.0* |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
0.5 | 6975 |
| 3 |
63.8* |
5.8* |
3.4* |
26.2* |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 5987 |
| B |
75.6* |
7.2* |
3.5* |
12.8* |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 4767 |
| A |
99.0* |
-- |
-- |
0.5* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 206 |
| C |
92.8* |
-- |
-- |
6.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 167 |
| E |
1.3* |
0.5* |
3.3* |
94.1* |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1014 |
| M |
3.0* |
82.8* |
1.6* |
3.5* |
0.2 |
0.4 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
2.9 |
4.3 | 830 |
| |
| Base Pair (125:236) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.2* |
10.2 |
18.4 |
0.5* |
0.1 |
55.2* |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.6 | 6897 |
| 3 |
16.4* |
0.5 |
20.5 |
0.3* |
-- |
61.6* |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 | 5909 |
| B |
-- |
0.2 |
25.4 |
0.1* |
-- |
73.6* |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 | 4679 |
| A |
-- |
1.4 |
7.8 |
-- |
-- |
89.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 | 217 |
| C |
-- |
-- |
11.4 |
-- |
-- |
87.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 166 |
| E |
96.0* |
1.6* |
0.5* |
1.3* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 1013 |
| M |
0.8 |
81.2* |
4.6* |
1.7 |
0.5* |
2.9 |
0.4 |
2.6* |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
4.4 | 831 |
| |
| Base Pair (126:235)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
42.7* |
5.5* |
8.6* |
21.4* |
5.2 |
0.3 |
0.5 |
0.5 |
-- |
0.6 |
-- |
3.0 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
10.5 |
1.0 | 6969 |
| 3 |
48.8* |
5.9* |
0.2* |
22.8* |
5.6 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
12.1 |
0.4 | 5980 |
| B |
61.2* |
6.7* |
0.2* |
27.8* |
3.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 | 4751 |
| A |
5.5 |
5.1* |
-- |
5.1 |
83.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 217 |
| C |
29.3* |
-- |
-- |
49.1* |
2.4 |
-- |
-- |
18.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
0.1* |
2.3* |
0.5 |
2.9 |
0.1 |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
20.4 |
-- |
0.2 |
0.5 |
71.1* |
0.3 | 1012 |
| M |
0.8* |
3.4* |
70.0* |
5.9* |
2.6 |
2.2 |
1.8 |
0.1 |
-- |
4.9 |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 |
1.1 |
5.8 | 831 |
| |
| Base Pair (127:234)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
55.8* |
2.4* |
8.5* |
13.1* |
1.8 |
3.6 |
0.8 |
0.2 |
0.1 |
2.0 |
0.4 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
9.5 |
0.9 | 6995 |
| 3 |
64.4* |
1.7* |
4.3* |
12.1* |
2.0 |
3.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
11.0 |
0.3 | 6006 |
| B |
76.3* |
1.5* |
4.5* |
13.8* |
2.3 |
0.7 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 4777 |
| A |
96.8* |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 216 |
| C |
1.2* |
-- |
-- |
97.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
1.1* |
2.6* |
4.3 |
6.6 |
1.3 |
15.7 |
0.2* |
-- |
0.1 |
1.9 |
-- |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.3 |
65.2* |
0.2 | 1013 |
| M |
4.6* |
7.9* |
40.8* |
2.9* |
0.8 |
7.3 |
6.5 |
0.6 |
0.2 |
14.9 |
3.4 |
0.7 |
0.7 |
0.1 |
0.5 |
0.6 |
7.4 | 831 |
| |
| Base Pair (128:233)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
61.6* |
4.1* |
4.0* |
20.3* |
0.6 |
0.7 |
1.4 |
1.4 |
0.3 |
0.8 |
0.4 |
0.2 |
0.4 |
0.4 |
0.9 |
0.6 |
2.0 | 6986 |
| 3 |
68.3* |
4.7* |
1.6* |
22.2* |
0.6 |
0.5 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 | 5997 |
| B |
85.0* |
3.8* |
0.9* |
7.5* |
0.4 |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 | 4770 |
| A |
7.0* |
44.1* |
16.4* |
31.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 213 |
| C |
97.0* |
-- |
-- |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 167 |
| E |
2.6* |
0.2* |
2.0* |
89.6* |
1.4 |
0.1 |
0.7 |
0.9 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
1.9 |
0.1 | 1014 |
| M |
5.8 |
1.2* |
22.0* |
9.7 |
1.1* |
1.8 |
10.5 |
10.2* |
2.2 |
6.4 |
1.3 |
1.1 |
2.6 |
0.2 |
7.7 |
2.2 |
13.9 | 831 |
| |
| Base Pair (129:232) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.4* |
13.5 |
19.1* |
2.7 |
0.4 |
22.5 |
2.5 |
2.0 |
29.0* |
0.5 |
0.3 |
0.1* |
1.9 |
0.3 |
0.4 |
0.7 |
2.5 | 6964 |
| 3 |
1.2* |
15.7 |
21.8* |
0.8 |
0.3 |
26.1 |
0.1 |
0.1 |
30.3* |
0.2 |
0.1 |
-- |
1.9 |
0.2 |
0.1 |
-- |
1.0 | 5974 |
| B |
1.5* |
17.8 |
11.5* |
1.0 |
0.4 |
25.1 |
0.1 |
0.1 |
38.0* |
0.2 |
0.2 |
-- |
2.4 |
0.3 |
0.1 |
-- |
1.2 | 4743 |
| A |
-- |
38.9 |
11.1 |
-- |
-- |
50.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 216 |
| C |
-- |
-- |
0.6* |
4.8 |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
91.0* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
0.1 |
0.8* |
72.3* |
-- |
0.1* |
25.7 |
0.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 | 1015 |
| M |
3.1* |
0.5* |
3.0 |
15.6 |
1.0 |
0.6 |
20.6* |
16.7 |
7.5 |
2.6 |
1.6 |
0.8 |
2.2 |
0.6 |
3.0 |
5.3* |
15.4 | 832 |
| |
|
| Base Pair (131:231)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.2* |
39.9* |
44.7* |
5.4* |
0.5 |
3.5 |
0.7 |
0.5 |
0.1 |
0.6 |
0.4 |
0.3 |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
0.4 |
1.1 | 6998 |
| 3 |
0.2* |
43.0* |
48.4* |
3.4* |
0.1 |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.3 | 6012 |
| B |
0.1* |
50.5* |
40.0* |
3.4* |
0.1 |
4.7 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.4 | 4782 |
| A |
2.8* |
74.1* |
5.1* |
14.8* |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 216 |
| C |
-- |
50.6* |
48.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 | 166 |
| E |
-- |
0.9* |
97.2* |
0.8* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1014 |
| M |
9.3* |
14.4* |
17.1* |
21.2* |
3.9 |
1.2 |
5.4 |
4.2 |
0.8 |
4.3 |
2.7 |
1.8 |
2.1 |
0.4 |
1.2 |
1.9 |
8.0 | 829 |
| |
| Base Pair (132:230)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
9.9* |
63.1* |
20.2* |
3.3* |
0.1 |
1.0 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.2 | 6974 |
| 3 |
11.4* |
65.3* |
17.9* |
3.6* |
0.1 |
0.8 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 | 5986 |
| B |
14.2* |
76.5* |
3.4* |
4.3* |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 | 4755 |
| A |
-- |
93.1* |
2.8* |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 216 |
| C |
0.6* |
83.7* |
12.0* |
0.6* |
-- |
1.8 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 166 |
| E |
0.3* |
7.0* |
89.2* |
0.2* |
-- |
2.7 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 1015 |
| M |
1.4* |
42.2* |
38.1* |
1.6* |
0.1 |
2.0 |
1.4 |
0.1 |
-- |
3.5 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 |
8.5 | 831 |
| |
|
| Base Pair (136:227)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
73.7* |
1.7 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
12.6* |
10.9 | 6934 |
| 3 |
0.1* |
82.0* |
1.9 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
14.7* |
0.6 | 5943 |
| B |
-- |
98.4* |
0.6* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 4743 |
| A |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 188 |
| C |
3.6* |
88.0* |
4.2* |
0.6* |
-- |
0.6 |
1.8 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 167 |
| E |
0.7* |
2.4* |
8.3 |
0.9 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.3 |
86.3* |
0.7 | 1013 |
| M |
-- |
10.3* |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2* |
0.1 |
-- |
-- |
88.9 | 832 |
| |
| Base Pair (137:226)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.8* |
44.3* |
36.1* |
2.2* |
1.2 |
2.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
11.2 | 6935 |
| 3 |
2.1* |
49.9* |
40.1* |
2.5* |
1.1 |
2.7 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.6 | 5944 |
| B |
1.8* |
53.9* |
38.3* |
0.4* |
0.6 |
3.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.6 | 4737 |
| A |
-- |
98.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 203 |
| C |
-- |
58.1* |
38.3* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 |
-- | 167 |
| E |
3.6* |
21.2* |
56.4* |
12.9* |
3.6 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 | 1005 |
| M |
0.1 |
1.0* |
6.9* |
0.2 |
2.2* |
-- |
-- |
0.1* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
89.0 | 832 |
| |
| Base Pair (138:225)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
20.5* |
12.0* |
30.6* |
12.9* |
0.4 |
7.9 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
3.6 |
10.8 | 6940 |
| 3 |
23.9* |
13.8* |
33.0* |
14.3* |
0.4 |
8.8 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
4.2 |
0.3 | 5949 |
| B |
10.5* |
17.3* |
36.4* |
17.8* |
0.5 |
11.0 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
5.2 |
0.4 | 4733 |
| A |
-- |
-- |
98.6 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- | 211 |
| C |
-- |
6.6* |
69.5* |
3.0* |
-- |
17.4 |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- | 167 |
| E |
92.2* |
0.3 |
3.4* |
0.5 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.5* |
-- |
0.5 |
1.5* |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 | 1006 |
| M |
0.4* |
0.4* |
5.4* |
4.8* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
89.0 | 832 |
| |
| Base Pair (139:224)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
9.8* |
6.2* |
23.9* |
27.5* |
12.0 |
5.1 |
1.1 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
2.4 |
10.6 | 6986 |
| 3 |
11.4* |
7.1* |
25.7* |
30.9* |
13.9 |
5.3 |
1.3 |
0.2 |
0.3 |
0.3 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
2.7 |
0.2 | 5995 |
| B |
11.4* |
7.1* |
31.1* |
20.5* |
16.8 |
6.6 |
1.4 |
0.1 |
0.2 |
0.3 |
-- |
0.4 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
3.4 |
0.2 | 4768 |
| A |
9.4* |
35.8* |
25.5* |
27.8* |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 212 |
| C |
-- |
3.6* |
67.1* |
1.8* |
0.6 |
22.8 |
1.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
1.2 |
-- | 167 |
| E |
12.1* |
1.3* |
0.1* |
80.3* |
3.1 |
0.1 |
0.6 |
0.4 |
0.7 |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 | 1016 |
| M |
0.4* |
0.1* |
2.0* |
7.8* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
88.9 | 832 |
| |
| Base Pair (140:223)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.5* |
13.9* |
32.8* |
18.6* |
5.1 |
4.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.3 |
0.4 |
3.8 |
10.7 | 6978 |
| 3 |
9.0* |
15.7* |
37.8* |
19.7* |
5.8 |
4.7 |
0.5 |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
0.3 |
0.3 |
0.5 |
4.4 |
0.4 | 5987 |
| B |
8.0* |
18.5* |
36.1* |
22.2* |
7.2 |
5.5 |
0.6 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.3 |
0.3 |
0.1 |
0.4 |
0.3 | 4760 |
| A |
46.3* |
8.4* |
12.1* |
25.7* |
0.5 |
2.8 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
0.5 |
2.3 | 214 |
| C |
33.5* |
6.0* |
10.8* |
39.5* |
5.4 |
0.6 |
-- |
0.6 |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
1.2 | 167 |
| E |
5.9* |
3.7* |
50.8* |
7.0* |
-- |
1.5 |
0.3 |
-- |
-- |
2.1 |
0.4 |
0.2 |
0.5 |
0.7 |
2.1 |
24.2 |
0.7 | 1014 |
| M |
0.1* |
2.6* |
1.6* |
5.6* |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
88.9 | 832 |
| |
| Base Pair (141:222)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
24.1* |
4.1* |
3.4* |
46.0* |
1.6 |
2.0 |
0.8 |
0.9 |
1.9 |
0.4 |
1.4 |
0.4 |
0.6 |
0.7 |
0.1 |
0.7 |
10.7 | 7002 |
| 3 |
25.2* |
4.8* |
3.9* |
52.4* |
1.9 |
2.4 |
0.9 |
1.1 |
2.3 |
0.5 |
1.6 |
0.5 |
0.7 |
0.8 |
0.1 |
0.8 |
0.3 | 6012 |
| B |
22.1* |
4.5* |
4.5* |
64.0* |
0.3 |
2.9 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.7 |
0.3 | 4787 |
| A |
87.2* |
-- |
-- |
10.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 211 |
| C |
94.0* |
0.6* |
0.6* |
3.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 167 |
| E |
26.8* |
6.9 |
1.8 |
6.3 |
9.7 |
0.4 |
5.1 |
5.7 |
13.3* |
2.5* |
9.6 |
2.4 |
3.8 |
4.3 |
0.3 |
1.1* |
0.1 | 1015 |
| M |
1.4* |
0.2* |
0.6* |
8.3* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
88.9 | 831 |
| |
| Base Pair (142:221)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
49.7* |
22.1* |
0.7* |
2.5* |
0.7 |
1.4 |
1.1 |
0.4 |
0.9 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.6 |
8.7 |
0.1 |
0.1 |
11.0 | 7034 |
| 3 |
54.3* |
25.7* |
0.7* |
2.5* |
0.7 |
1.5 |
1.2 |
0.4 |
1.0 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.7 |
10.1 |
0.1 |
0.1 |
0.6 | 6043 |
| B |
63.7* |
31.6* |
0.4* |
2.2* |
0.7 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.5 | 4814 |
| A |
95.8* |
2.3* |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.5 | 216 |
| C |
92.2* |
0.6* |
1.2* |
3.6* |
0.6 |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- | 167 |
| E |
0.6 |
2.7 |
2.4 |
4.6 |
1.0 |
8.4 |
6.8* |
2.1 |
6.2 |
0.3 |
-- |
0.2 |
3.2 |
59.7* |
-- |
0.4* |
1.6 | 1014 |
| M |
7.6* |
0.1* |
0.2* |
2.3* |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
88.9 | 832 |
| |
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