16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1241
Base Pair (1241:1296)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
83.6* |
1.2* |
12.1* |
1.4* |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 | 7162 |
3 |
98.8* |
-- |
-- |
0.8* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 5848 |
B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4624 |
A |
98.5 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 204 |
C |
95.8* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
E |
95.0* |
-- |
0.1* |
4.7* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1018 |
M |
4.1* |
7.4* |
75.5* |
4.2* |
0.3 |
0.7 |
1.3 |
0.1 |
-- |
1.6 |
0.1 |
1.9 |
-- |
0.2 |
1.2 |
1.0 |
0.4 | 1153 |
|
Base Pair (1242:1295)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
9.2 |
1.9* |
13.6* |
13.9 |
59.9* |
0.2 |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- | 7109 |
3 |
9.2 |
1.4* |
0.6* |
15.9 |
72.2* |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 | 5795 |
B |
8.0 |
1.8* |
0.1* |
0.2 |
89.3* |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 | 4566 |
A |
49.8* |
-- |
-- |
0.5* |
47.3 |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 207 |
C |
51.2* |
0.6* |
-- |
6.5* |
39.9 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
E |
6.0* |
-- |
3.2* |
89.5* |
0.9 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 1020 |
M |
2.9* |
4.6* |
81.3* |
4.8* |
0.7 |
1.3 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.5 |
2.4 |
-- |
0.2 |
0.3 |
0.4 | 1153 |
|
Base Pair (1243:1294)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
6.5* |
55.3* |
21.2* |
7.8* |
2.1 |
3.7 |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.6 | 7160 |
3 |
7.9* |
50.5* |
24.1* |
9.2* |
2.2 |
4.1 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.9 | 5848 |
B |
6.5* |
57.1* |
20.5* |
7.3* |
2.6 |
5.0 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- | 4619 |
A |
4.9* |
52.4* |
23.8* |
5.8* |
3.9 |
4.4 |
-- |
2.4 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
1.0 |
-- | 206 |
C |
2.4* |
25.1* |
19.2* |
12.0* |
9.6 |
14.4 |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 167 |
E |
14.7* |
20.3* |
40.0* |
18.2* |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
4.6 | 1021 |
M |
0.2* |
83.5* |
6.6* |
0.5* |
0.1 |
0.2 |
0.8 |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
7.0 | 1152 |
|
Base Pair (1244:1293)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
25.1* |
33.1* |
25.7* |
10.6* |
1.4 |
1.4 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
1.2 | 7080 |
3 |
30.6* |
38.4* |
14.0* |
11.9* |
1.8 |
1.6 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.1 | 5768 |
B |
26.1* |
43.1* |
15.4* |
11.7* |
1.8 |
1.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 | 4543 |
A |
11.2* |
43.9* |
22.9* |
19.5* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
-- | 205 |
C |
3.0* |
57.5* |
31.7* |
4.8* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 167 |
E |
54.6* |
15.9* |
6.4* |
11.3* |
1.9 |
4.4 |
2.1 |
0.3 |
0.5 |
0.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 |
1.3 |
0.6 | 1018 |
M |
0.4* |
2.9* |
82.9* |
5.1* |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
7.4 | 1153 |
|
Base Pair (1245:1292)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
51.0* |
11.3* |
9.9* |
19.8* |
1.4 |
0.3 |
1.6 |
1.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.9 |
1.9 | 7177 |
3 |
59.9* |
13.7* |
9.8* |
12.6* |
1.6 |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.7 |
0.5 | 5864 |
B |
62.4* |
10.8* |
11.5* |
13.0* |
1.2 |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- | 4637 |
A |
68.9* |
1.5* |
8.3* |
18.9* |
1.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 206 |
C |
69.2* |
1.2* |
0.6* |
21.9* |
2.4 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
1.2 | 169 |
E |
46.3* |
29.4* |
2.7* |
9.6* |
3.6 |
0.4 |
0.4 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
0.4 |
-- |
3.5 |
2.2 | 1019 |
M |
2.5* |
0.5* |
11.8* |
56.1* |
0.3 |
-- |
9.1 |
6.1 |
0.2 |
0.3 |
0.1 |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.8 |
2.0 |
9.7 | 1152 |
|
Base Pair (1246:1291)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
48.2* |
4.0 |
3.4 |
19.8* |
0.5 |
6.5* |
0.7 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.7 |
0.1 |
0.6 |
14.9 | 7202 |
3 |
57.3* |
4.8 |
3.5 |
23.1* |
0.4 |
7.9* |
0.8 |
0.1 |
0.1 |
0.1* |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.8 |
0.1 |
0.3 |
0.5 | 5888 |
B |
62.0* |
5.9 |
3.3 |
16.3* |
0.3 |
9.5* |
0.9 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.0 |
0.1 |
0.2 |
0.1 | 4658 |
A |
75.4* |
1.9 |
1.4 |
15.0* |
-- |
6.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 207 |
C |
56.0* |
1.2* |
4.2* |
32.1* |
4.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 168 |
E |
32.5* |
0.6* |
4.5* |
56.1* |
0.9 |
0.8 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
1.0 |
2.3 | 1021 |
M |
0.1* |
0.2* |
3.0* |
1.1* |
0.8 |
0.3 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
92.1 | 1154 |
|
Base Pair (1247:1290)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
10.5* |
0.8 |
17.3 |
2.7* |
1.4 |
36.9* |
1.8 |
2.4 |
0.2 |
1.6* |
0.3 |
0.4 |
5.5 |
0.2 |
1.4 |
1.4 |
15.2 | 7182 |
3 |
10.3* |
0.9 |
20.7 |
3.1* |
1.6 |
45.0* |
1.6 |
2.8 |
0.3 |
1.9* |
0.4 |
0.4 |
6.7 |
0.1 |
1.7 |
1.7 |
0.6 | 5867 |
B |
4.8 |
0.6 |
23.9 |
1.8* |
0.2 |
54.6* |
1.9 |
0.3 |
0.2 |
1.9 |
0.2* |
0.1 |
8.5* |
0.2 |
0.4 |
0.3 |
0.2 | 4639 |
A |
93.2* |
1.0* |
4.9* |
0.5* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 206 |
C |
85.8* |
0.6* |
4.7* |
3.0* |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
0.6 | 169 |
E |
18.7* |
2.2 |
9.2 |
9.4* |
8.5 |
10.6* |
0.4 |
15.1 |
0.8 |
2.4* |
1.6 |
2.0 |
0.2 |
-- |
7.9 |
8.2 |
2.9 | 1020 |
M |
0.3* |
0.2 |
1.6 |
1.0 |
-- |
1.0* |
2.9* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
0.2 |
-- |
92.0 | 1154 |
|
|
Base Pair (1253:1284)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
58.5* |
1.6* |
0.1* |
1.4* |
6.1 |
0.1 |
0.4 |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
1.7 |
0.2 |
0.1 |
-- |
29.2 | 7208 |
3 |
69.0* |
1.7* |
0.1* |
0.8* |
7.4 |
-- |
0.4 |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
1.9 |
0.2 |
0.1 |
-- |
17.5 | 5894 |
B |
83.0* |
2.2* |
-- |
1.0* |
9.2 |
-- |
0.5 |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
2.3 |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.3 | 4658 |
A |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 207 |
C |
58.3* |
6.0* |
1.2* |
17.3* |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
6.0 |
-- |
-- |
-- |
8.9 | 168 |
E |
0.1* |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.1* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
98.9 | 1027 |
M |
4.3* |
-- |
0.3* |
1.8* |
0.6 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
92.6 | 1154 |
|
Base Pair (1254:1283)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
34.4* |
3.7* |
1.8* |
16.0* |
14.1 |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
28.9 | 7214 |
3 |
40.5* |
4.5* |
2.1* |
17.4* |
16.8 |
0.2 |
0.1 |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
17.5 | 5900 |
B |
49.2* |
5.6* |
2.6* |
21.9* |
19.2 |
0.2 |
0.1 |
0.8 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 4664 |
A |
45.4 |
0.5* |
-- |
2.4 |
47.8* |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
2.9 | 207 |
C |
23.2* |
-- |
2.4* |
59.5* |
13.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 168 |
E |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
99.3 | 1027 |
M |
4.4* |
-- |
0.3* |
2.4* |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
92.5 | 1154 |
|
Base Pair (1255:1282)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
69.5* |
-- |
0.1* |
0.3* |
0.8 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
28.8 | 7218 |
3 |
81.8 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
17.4 | 5904 |
B |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4668 |
A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 207 |
C |
81.5* |
-- |
4.2* |
5.4* |
4.8 |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 | 168 |
E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.7 | 1027 |
M |
4.3* |
-- |
0.1* |
1.2* |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
92.4 | 1154 |
|
|
Base Pair (1258:1277)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
65.7* |
1.7* |
0.1* |
0.7* |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
30.5 | 7169 |
3 |
76.8* |
2.0* |
0.1* |
0.5* |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
19.3 | 5855 |
B |
96.0* |
0.1* |
-- |
0.5* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
2.3 | 4621 |
A |
28.8* |
56.1* |
1.5* |
2.4* |
-- |
11.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
C |
89.3* |
-- |
3.0* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.8 |
2.4 | 168 |
E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1027 |
M |
5.5* |
0.1 |
-- |
1.5* |
-- |
0.2* |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
92.5 | 1154 |
|
Base Pair (1259:1276)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
68.1* |
0.3* |
0.1 |
0.3* |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
30.2 | 7184 |
3 |
-- |
79.7* |
0.1* |
-- |
0.3* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
18.9 | 5871 |
B |
-- |
96.5* |
0.1* |
-- |
0.4* |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
1.7 | 4635 |
A |
-- |
98.6 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 207 |
C |
-- |
86.8* |
3.0* |
-- |
-- |
2.4 |
2.4 |
0.6* |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
3.0 | 167 |
E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1027 |
M |
-- |
5.6* |
1.0* |
0.3* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
92.5 | 1154 |
|
|
Base Pair (1263:1272)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
6.3* |
22.2* |
3.0* |
25.9* |
10.8 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
30.5 | 7192 |
3 |
7.2* |
25.5* |
3.0* |
30.6* |
13.1 |
0.4 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
19.2 | 5878 |
B |
8.9* |
29.6* |
3.3* |
37.7* |
16.6 |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
2.1 | 4642 |
A |
6.3* |
60.4* |
11.1* |
21.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 207 |
C |
1.2* |
58.9* |
20.2* |
4.8* |
3.0 |
0.6 |
1.8 |
-- |
1.8 |
1.2 |
1.2 |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
1.2 |
3.0 | 168 |
E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1027 |
M |
2.2* |
-- |
0.2* |
4.8* |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
92.6 | 1154 |
|
Base Pair (1264:1271)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
5.5* |
45.5* |
12.0* |
2.1* |
0.4 |
3.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
30.4 | 7189 |
3 |
6.6* |
53.8* |
13.3* |
2.1* |
0.5 |
3.9 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
19.1 | 5875 |
B |
8.3* |
64.1* |
16.7* |
2.7* |
0.6 |
4.7 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
2.1 | 4640 |
A |
-- |
89.8* |
3.4* |
-- |
-- |
6.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 206 |
C |
-- |
53.6* |
30.4* |
1.8* |
-- |
4.2 |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
6.0 | 168 |
E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1027 |
M |
0.8* |
1.6* |
2.6* |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
92.7 | 1154 |
|
Base Pair (1265:1270)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
7.8* |
44.4* |
5.2* |
6.7* |
0.2 |
4.7 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
30.4 | 7165 |
3 |
9.5* |
52.8* |
4.6* |
7.9* |
0.2 |
5.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
19.0 | 5851 |
B |
12.1* |
63.2* |
5.3* |
10.0* |
0.3 |
6.5 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.9 | 4616 |
A |
-- |
82.0* |
13.1* |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 206 |
C |
-- |
50.0* |
39.9* |
1.2* |
0.6 |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
4.2 | 168 |
E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1027 |
M |
0.1* |
0.4* |
3.2* |
1.1* |
-- |
2.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.6 | 1154 |
|
Last generated : Fri Jun 16 2000 (14 : 29)