16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 17
| Base Pair (17:918) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1* |
98.3* |
0.1* |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.4 | 3912 |
| 3 |
-- |
-- |
98.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.3 | 3123 |
| B |
-- |
-- |
99.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 | 2163 |
| A |
-- |
-- |
98.6 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 148 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 117 |
| E |
-- |
-- |
96.8* |
0.1* |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.1 |
0.5 | 812 |
| M |
-- |
0.4* |
97.3* |
0.4* |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.3 |
0.3 | 672 |
| |
| Base Pair (18:917) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
92.5* |
3.9* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.3 |
1.7 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 3930 |
| 3 |
-- |
92.8* |
3.9* |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.2 |
2.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 3137 |
| B |
-- |
95.2* |
3.0* |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 2163 |
| A |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 149 |
| C |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 118 |
| E |
-- |
85.5* |
7.2* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
6.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 825 |
| M |
3.4* |
90.1* |
4.7* |
0.1* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 | 675 |
| |
| Base Pair (19:916) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
86.3* |
1.4* |
8.0* |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
1.3 |
0.4 |
0.1 |
1.8 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 | 3959 |
| 3 |
-- |
85.3* |
0.9* |
9.6* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
1.2 |
0.3 |
0.1 |
2.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 3166 |
| B |
-- |
79.9* |
0.3* |
13.9* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
1.7 |
0.2 |
0.1 |
3.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 2190 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| C |
-- |
91.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 117 |
| E |
-- |
97.0* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 826 |
| M |
0.4* |
90.7* |
4.4* |
1.9* |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.4 |
0.9 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 | 676 |
| |
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