16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 184
| Base Pair (184:193)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.6* |
19.9* |
9.3* |
19.8* |
6.2 |
2.0 |
0.2 |
0.3 |
1.4 |
0.2 |
0.3 |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
0.5 |
1.4 |
26.4 | 7034 |
| 3 |
11.8* |
23.1* |
10.7* |
22.6* |
5.8 |
2.3 |
0.1 |
0.3 |
1.6 |
0.2 |
0.3 |
0.3 |
0.1 |
0.2 |
0.5 |
1.6 |
18.4 | 6041 |
| B |
14.6* |
29.0* |
13.3* |
28.1* |
6.0 |
2.7 |
0.2 |
0.4 |
1.9 |
0.2 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
0.9 |
1.8 | 4800 |
| A |
3.7 |
1.4 |
4.2 |
6.5 |
29.4* |
4.7 |
-- |
0.5 |
3.3* |
-- |
5.6 |
0.5 |
-- |
-- |
14.0* |
25.7 |
0.5 | 214 |
| C |
33.7 |
1.2* |
3.6* |
7.1 |
52.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 169 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1028 |
| M |
5.5* |
0.1 |
0.2 |
2.2* |
0.1 |
0.2* |
0.8 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
90.2 | 832 |
| |
| Base Pair (185:192)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.1* |
32.9* |
20.0* |
8.6* |
1.1 |
4.9 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
1.2 |
25.8 | 7065 |
| 3 |
4.3* |
35.5* |
23.1* |
9.6* |
1.3 |
5.6 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
1.3 |
17.8 | 6072 |
| B |
4.3* |
42.7* |
28.5* |
11.4* |
1.7 |
7.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.6 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
1.7 |
1.3 | 4829 |
| A |
25.5* |
42.6* |
12.5* |
14.4* |
-- |
0.9 |
1.9 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 216 |
| C |
-- |
89.9* |
4.1* |
3.6* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 169 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1028 |
| M |
3.2* |
2.4* |
0.5* |
2.4* |
-- |
0.4 |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
90.0 | 832 |
| |
| Base Pair (186:191)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.5* |
53.7* |
3.7* |
2.0* |
0.2 |
5.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.4 |
26.2 | 7040 |
| 3 |
8.7* |
62.1* |
1.8* |
1.7* |
0.3 |
5.9 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
18.2 | 6048 |
| B |
10.9* |
73.9* |
2.0* |
2.1* |
0.3 |
7.4 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
0.6 |
1.6 | 4806 |
| A |
-- |
94.4* |
3.7* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 215 |
| C |
-- |
14.9* |
76.2* |
1.8* |
0.6 |
4.8 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 168 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1028 |
| M |
0.4* |
0.5* |
2.9* |
4.7* |
-- |
0.2 |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
90.2 | 832 |
| |
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