16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 367
| Base Pair (367:393) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
2.7* |
95.7* |
0.1* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 7180 |
| 3 |
0.7* |
3.1* |
95.4* |
0.1* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 6193 |
| B |
0.4* |
-- |
99.2* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4947 |
| A |
10.9* |
84.3* |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 | 229 |
| C |
-- |
-- |
98.2 |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 165 |
| E |
0.1* |
0.1* |
98.0* |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1017 |
| M |
-- |
0.2* |
97.5* |
-- |
0.1* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.5 |
0.6 | 830 |
| |
|
| Base Pair (369:392)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
55.5* |
18.1* |
3.5* |
17.4* |
0.2 |
0.7 |
2.6 |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.7 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.3 | 7188 |
| 3 |
61.0* |
18.6* |
2.8* |
16.1* |
0.2 |
0.8 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 6200 |
| B |
74.8* |
20.9* |
1.7* |
1.4* |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 4944 |
| A |
0.9* |
51.7* |
39.1* |
-- |
-- |
6.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 | 230 |
| C |
0.6* |
92.7* |
4.8* |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 165 |
| E |
8.2* |
-- |
-- |
90.4* |
0.9 |
0.1* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1026 |
| M |
24.5* |
-- |
8.3* |
31.3* |
0.7 |
0.1 |
22.9 |
4.8 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
5.8 |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.5 | 831 |
| |
| Base Pair (370:391)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
27.8* |
59.1* |
2.0* |
9.4* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 | 7174 |
| 3 |
30.5* |
66.0* |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.2 |
0.7 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 6189 |
| B |
37.7* |
60.6* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.8 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4944 |
| A |
1.8* |
49.5* |
46.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.3 | 220 |
| C |
-- |
93.9* |
6.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 164 |
| E |
1.6* |
95.5* |
1.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 1025 |
| M |
13.4* |
0.2* |
1.8* |
81.2* |
0.6 |
0.8 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.6 | 829 |
| |
| Base Pair (371:390)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
31.3* |
14.7* |
4.7* |
47.6* |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.5 |
0.2 |
0.1 |
0.1 | 7132 |
| 3 |
23.1* |
17.1* |
4.5* |
53.8* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.6 |
0.1 |
0.1 |
-- | 6146 |
| B |
26.9* |
0.2* |
5.4* |
65.7* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.7 |
0.1 |
0.1 |
-- | 4891 |
| A |
44.8* |
10.9* |
0.9* |
40.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- | 230 |
| C |
95.8* |
-- |
-- |
4.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 165 |
| E |
-- |
99.0* |
0.6* |
0.1* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1025 |
| M |
78.8* |
0.1* |
7.7* |
9.7* |
0.1 |
0.5 |
0.6 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
0.2 |
0.7 | 829 |
| |
|
| Base Pair (375:388)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
0.9 |
-- |
-- |
97.8 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
0.4 | 6852 |
| 3 |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
98.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.3 | 5867 |
| B |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- | 4613 |
| A |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
95.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 | 228 |
| C |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 164 |
| E |
0.1* |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
98.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
1.3 | 1026 |
| M |
0.2* |
0.4 |
5.1 |
-- |
-- |
92.9* |
0.4* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.6 | 829 |
| |
| Base Pair (376:387)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.6 |
12.7* |
1.0* |
5.3 |
74.8* |
0.1 |
-- |
0.2* |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
1.2 |
0.7 | 7139 |
| 3 |
2.6 |
14.6* |
0.7* |
0.1 |
80.8* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 6151 |
| B |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 4898 |
| A |
61.6* |
-- |
-- |
0.4* |
32.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
1.7 |
-- |
-- |
3.1 | 229 |
| C |
0.6 |
-- |
0.6* |
2.4 |
92.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
3.6 | 165 |
| E |
1.5 |
87.9* |
4.2* |
0.4 |
3.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.8 | 1024 |
| M |
11.6* |
1.2* |
4.1* |
43.8* |
25.9 |
0.4 |
0.1 |
1.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
10.0 |
1.1 | 831 |
| |
| Base Pair (377:386)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
70.0* |
16.1* |
0.8* |
10.9* |
0.5 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.8 | 7193 |
| 3 |
77.9* |
18.6* |
0.8* |
1.0* |
0.3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.5 | 6205 |
| B |
97.1* |
0.2* |
-- |
1.2* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.6 | 4952 |
| A |
-- |
88.6* |
3.9* |
-- |
-- |
4.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.9 | 228 |
| C |
81.2* |
-- |
-- |
4.2* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
12.1 | 165 |
| E |
2.2* |
91.8* |
4.2* |
0.7* |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 1025 |
| M |
8.5* |
0.7* |
1.0* |
86.6* |
1.2 |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.2 | 831 |
| |
| Base Pair (378:385)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
67.8* |
6.2* |
5.4* |
17.6* |
0.1 |
0.9 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
1.3 | 7208 |
| 3 |
70.0* |
6.7* |
6.1* |
14.4* |
0.1 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
1.0 | 6220 |
| B |
82.6* |
0.2* |
0.5* |
15.5* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.7 | 4967 |
| A |
58.3* |
0.4* |
3.1* |
37.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 228 |
| C |
82.4* |
-- |
-- |
4.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.3 | 165 |
| E |
11.8* |
39.5* |
33.6* |
4.0* |
-- |
6.1 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
3.9 | 1025 |
| M |
47.7* |
3.9* |
1.8* |
44.2* |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.8 |
0.6 | 831 |
| |
| Base Pair (379:384)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
31.5* |
60.3* |
2.5* |
0.6* |
0.2 |
1.0 |
0.4 |
1.9 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.9 | 7205 |
| 3 |
36.4* |
57.9* |
0.2 |
0.4 |
0.2 |
0.5 |
0.5* |
2.2 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.9 | 6217 |
| B |
28.0* |
70.1* |
-- |
0.1* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 | 4962 |
| A |
44.5* |
48.9* |
-- |
5.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 229 |
| C |
-- |
95.8* |
1.8* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 165 |
| E |
75.6* |
0.7* |
1.4 |
0.8 |
1.1 |
0.3 |
3.0* |
13.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.1* |
3.2 | 1026 |
| M |
0.7* |
71.1* |
19.7* |
2.2* |
0.4 |
4.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.5 | 831 |
| |
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