16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 441
| Base Pair (441:493) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.1* |
6.6* |
0.7 |
6.1 |
2.5 |
2.0 |
28.3* |
1.7 |
0.9 |
0.3 |
-- |
0.1 |
12.4 |
1.2 |
0.1 |
0.1* |
26.7 | 6927 |
| 3 |
11.6* |
5.9* |
0.5 |
6.9 |
2.8 |
2.3 |
32.9* |
1.9 |
0.9 |
0.3 |
-- |
0.1 |
14.3 |
1.1 |
0.1 |
-- |
18.2 | 5937 |
| B |
14.1* |
4.2* |
0.6 |
8.8 |
3.5 |
2.9 |
41.7* |
2.4 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
18.0 |
1.4 |
0.1 |
-- |
1.1 | 4684 |
| A |
13.0* |
69.1* |
0.9 |
-- |
1.8 |
0.4 |
1.3* |
0.9 |
3.6 |
6.3 |
-- |
0.4 |
1.3 |
-- |
0.9 |
-- |
-- | 223 |
| C |
3.1* |
67.5* |
11.0* |
4.3* |
1.2 |
-- |
0.6 |
-- |
4.3 |
4.9 |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
0.4 |
-- |
0.5 |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.5* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
1.0 |
2.2* |
0.1 |
1.0* |
93.6 | 835 |
| |
| Base Pair (442:492)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
24.4* |
11.1* |
27.6* |
4.7* |
0.6 |
1.0 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
1.7 |
0.1 |
-- |
1.4 |
25.9 | 6961 |
| 3 |
28.4* |
12.3* |
29.6* |
5.4* |
0.7 |
1.1 |
0.2 |
0.1 |
0.4 |
0.5 |
0.2 |
-- |
1.9 |
0.1 |
0.1 |
1.5 |
17.5 | 5971 |
| B |
35.5* |
14.0* |
36.6* |
5.5* |
0.7 |
1.3 |
0.3 |
0.2 |
0.5 |
0.6 |
0.2 |
-- |
2.4 |
0.1 |
0.1 |
1.7 |
0.2 | 4708 |
| A |
10.3* |
34.3* |
21.0* |
26.2* |
2.1 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
3.0 |
0.4 | 233 |
| C |
0.6* |
21.5* |
74.8* |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
0.4* |
-- |
3.7* |
0.2* |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
1.2 |
93.4 | 835 |
| |
| Base Pair (443:491)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.1* |
31.9* |
20.7* |
10.2* |
0.5 |
2.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
2.0 |
26.2 | 6883 |
| 3 |
6.0* |
34.6* |
23.5* |
11.8* |
0.6 |
2.7 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
2.3 |
17.6 | 5894 |
| B |
5.9* |
42.1* |
29.7* |
14.8* |
0.5 |
3.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
2.5 |
0.1 | 4634 |
| A |
33.5* |
39.6* |
4.3 |
3.9 |
3.5 |
3.5 |
0.4* |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.3* |
0.4 | 230 |
| C |
0.6* |
83.3* |
11.7* |
1.2* |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- | 162 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
0.1* |
2.5* |
2.3* |
0.6* |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
93.1 | 835 |
| |
| Base Pair (444:490)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
17.5* |
10.1* |
6.1* |
36.3* |
1.1 |
0.8 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
1.0 |
26.3 | 6958 |
| 3 |
19.8* |
11.8* |
7.1* |
40.2* |
0.7 |
1.0 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.1 |
17.8 | 5968 |
| B |
23.9* |
13.3* |
8.7* |
49.3* |
0.7 |
1.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.3 |
0.6 | 4705 |
| A |
23.6* |
33.5* |
4.3* |
33.5* |
1.7 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- | 233 |
| C |
9.2* |
-- |
1.2* |
65.0* |
22.7 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
2.5* |
-- |
0.4* |
3.0* |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
93.0 | 835 |
| |
| Base Pair (445:489)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
55.3* |
1.1* |
2.0* |
12.8* |
1.1 |
1.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
25.7 | 7003 |
| 3 |
62.4* |
1.3* |
2.1* |
13.8* |
1.2 |
1.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
17.1 | 6013 |
| B |
77.9* |
1.7 |
1.5 |
14.9* |
1.5 |
1.9* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- | 4751 |
| A |
22.4* |
-- |
22.8* |
51.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- | 232 |
| C |
71.8* |
-- |
1.2* |
23.3* |
-- |
-- |
1.2 |
1.8 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
0.2* |
0.1* |
1.4* |
4.0* |
0.5 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
93.2 | 835 |
| |
| Base Pair (446:488)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
53.9* |
4.5* |
3.5* |
6.7* |
0.2 |
3.9 |
0.4 |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
25.6 | 7013 |
| 3 |
61.4* |
5.2* |
4.0* |
5.9* |
0.1 |
4.5 |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
17.1 | 6023 |
| B |
74.9* |
4.8 |
4.8 |
7.4* |
0.2 |
5.7* |
0.5 |
0.2 |
-- |
0.7* |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- | 4758 |
| A |
57.0* |
36.6* |
4.3* |
2.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 235 |
| C |
34.4* |
-- |
0.6* |
62.0* |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
2.9* |
0.1* |
0.7* |
1.7* |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
93.2 | 835 |
| |
|
| Base Pair (450:483) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
66.4* |
0.7* |
1.8* |
0.9* |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
29.2 | 7036 |
| 3 |
74.3* |
0.9* |
2.0* |
1.0* |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
21.1 | 6047 |
| B |
94.0* |
1.1* |
2.6* |
1.3* |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 4780 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
93.2* |
-- |
0.6* |
1.9* |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
0.6 | 162 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
3.4* |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
94.1 | 835 |
| |
|
| Base Pair (455:477)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.6* |
10.0* |
6.1* |
3.4* |
6.3 |
0.9 |
0.3 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.6 |
0.2 |
0.4 |
0.1 |
62.3 | 6977 |
| 3 |
10.0* |
11.7* |
7.2* |
3.9* |
7.4 |
1.0 |
0.2 |
0.3 |
0.3 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.7 |
0.2 |
0.5 |
0.2 |
56.2 | 5988 |
| B |
12.6* |
14.9* |
9.1* |
5.0* |
9.4 |
1.2 |
0.2 |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
0.8 |
0.2 |
0.6 |
0.2 |
44.5 | 4720 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.4 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2* |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.5 | 835 |
| |
| Base Pair (456:476)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.9* |
10.1* |
9.0* |
5.8* |
2.5 |
3.5 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
62.9 | 6965 |
| 3 |
5.7* |
11.8* |
10.5* |
6.6* |
2.9 |
4.1 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
56.9 | 5976 |
| B |
7.2* |
15.0* |
13.3* |
8.4* |
3.7 |
5.2 |
0.1 |
0.2 |
0.3 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
45.3 | 4708 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
-- |
-- |
0.1* |
1.2* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.5 | 835 |
| |
| Base Pair (457:475)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.2* |
5.3* |
6.6* |
8.3* |
4.8 |
3.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
0.7 |
63.0 | 6972 |
| 3 |
8.3* |
6.2* |
7.7* |
9.7* |
5.6 |
3.6 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.6 |
57.1 | 5983 |
| B |
10.6* |
7.9* |
9.7* |
12.3* |
7.2 |
4.6 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
0.1 |
0.8 |
45.5 | 4715 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
98.5 | 835 |
| |
| Base Pair (458:474)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.7* |
6.5* |
8.9* |
6.4* |
4.0 |
3.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
63.8 | 6990 |
| 3 |
6.6* |
7.5* |
10.4* |
7.4* |
4.7 |
3.8 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.4 |
57.9 | 6001 |
| B |
8.3* |
9.5* |
13.2* |
9.4* |
5.9 |
4.8 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.5 |
46.6 | 4733 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
-- |
0.1* |
0.1* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 | 835 |
| |
| Base Pair (459:473)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.2* |
5.5* |
8.6* |
6.4* |
1.4 |
2.8 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.4 |
63.9 | 6984 |
| 3 |
11.9* |
6.4* |
10.0* |
7.3* |
1.7 |
3.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.4 |
58.3 | 5995 |
| B |
15.1* |
8.1* |
12.6* |
9.2* |
2.1 |
4.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
0.5 |
47.0 | 4727 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
-- |
-- |
0.1* |
1.1* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
98.5 | 835 |
| |
| Base Pair (460:472)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.0* |
2.8 |
3.4 |
11.9* |
1.7 |
4.4* |
0.7 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
0.2 |
-- |
0.4 |
65.2 | 6996 |
| 3 |
9.4* |
3.2 |
4.0 |
13.9* |
2.0 |
5.1* |
0.9 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 |
0.3 |
-- |
0.3 |
59.7 | 6007 |
| B |
11.9* |
4.1 |
5.0 |
17.6* |
2.5 |
6.4* |
1.1 |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
0.8 |
0.3 |
-- |
0.4 |
48.9 | 4739 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.1 |
98.7 | 835 |
| |
| Base Pair (461:471)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
9.4* |
2.0* |
4.9* |
5.7* |
4.4 |
3.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
0.2 |
0.3 |
68.9 | 7024 |
| 3 |
10.9* |
2.3* |
5.7* |
6.5* |
5.1 |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.6 |
0.1 |
0.3 |
0.3 |
64.0 | 6035 |
| B |
13.8* |
3.0* |
7.2* |
8.3* |
6.5 |
4.5 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
0.7 |
0.1 |
0.3 |
0.4 |
54.5 | 4767 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.6 | 835 |
| |
| Base Pair (462:470)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
12.2* |
1.9 |
1.6* |
1.1 |
0.8 |
2.1 |
0.6 |
0.2 |
8.0* |
0.1 |
0.1 |
0.1* |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
70.5 | 7036 |
| 3 |
14.1* |
2.3 |
1.9* |
1.2 |
0.9 |
2.4 |
0.6 |
0.2 |
9.3* |
0.1 |
0.1 |
0.1* |
0.3 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
65.8 | 6047 |
| B |
17.9* |
2.9 |
2.4* |
1.5 |
1.2 |
3.0 |
0.7 |
0.3 |
11.8* |
0.1 |
0.1 |
0.2* |
0.4 |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
56.8 | 4779 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 237 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
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-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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100.0 | 163 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 1030 |
| M |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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0.1* |
-- |
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98.8 | 835 |
| |
Last generated : Fri Jun 16 2000 (14 : 29)