16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 505
| Base Pair (505:526) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
98.6* |
0.2* |
0.2* |
0.1* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 | 6520 |
| 3 |
98.8* |
0.2* |
0.1* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 | 5536 |
| B |
98.5* |
0.2* |
0.1* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 | 4329 |
| A |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 205 |
| C |
99.4* |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 161 |
| E |
99.7 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1002 |
| M |
97.0* |
0.1* |
0.5* |
0.6* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 831 |
| |
| Base Pair (506:525) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
97.6* |
-- |
0.1* |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 6563 |
| 3 |
98.7* |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 | 5579 |
| B |
99.0* |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 4377 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 204 |
| C |
98.1* |
-- |
1.2* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 160 |
| E |
96.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.2 | 998 |
| M |
89.3* |
0.2* |
0.8* |
8.1* |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.4 |
-- | 832 |
| |
| Base Pair (507:524) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
89.5* |
8.7* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 6527 |
| 3 |
-- |
98.4* |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1* |
0.3 |
0.1 |
0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5544 |
| B |
-- |
99.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4344 |
| A |
-- |
93.5 |
-- |
-- |
-- |
4.5 |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 201 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 160 |
| E |
-- |
96.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
0.8 |
-- |
2.3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 999 |
| M |
-- |
28.8* |
68.2* |
0.4* |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 831 |
| |
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