16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 567
| Base Pair (567:883)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
84.5* |
14.2* |
0.3* |
0.3* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 6761 |
| 3 |
82.4* |
16.8* |
0.3* |
0.1* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 5721 |
| B |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4511 |
| A |
99.1* |
-- |
-- |
0.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 213 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 162 |
| E |
-- |
96.2* |
1.5* |
0.5* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 997 |
| M |
95.5* |
0.1* |
0.5* |
2.6* |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 884 |
| |
| Base Pair (568:882)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
86.4* |
0.1* |
0.5* |
8.0* |
0.1 |
-- |
-- |
4.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 6764 |
| 3 |
84.3* |
0.1* |
0.5* |
9.3* |
0.1 |
-- |
-- |
5.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5727 |
| B |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 4516 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 212 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 162 |
| E |
13.1* |
0.5* |
2.9* |
53.5* |
0.4 |
-- |
-- |
29.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 999 |
| M |
97.6* |
0.1* |
0.6* |
0.5* |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.2 | 881 |
| |
| Base Pair (569:881)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.6* |
77.3* |
6.6* |
0.1* |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 6740 |
| 3 |
17.3* |
75.1* |
6.5* |
0.1* |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 5704 |
| B |
-- |
91.3* |
7.5* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4484 |
| A |
-- |
84.0* |
15.5* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 219 |
| C |
-- |
96.9* |
2.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 161 |
| E |
98.4* |
-- |
-- |
0.4* |
0.8 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 1001 |
| M |
0.2* |
88.1* |
9.1* |
0.2* |
0.1 |
0.7 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
0.3 | 881 |
| |
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