16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 570


Base Pair (570:866)   (Tertiary) Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 76.0* 2.9* 19.8* 0.3* 0.1 -- 0.1 0.1 0.1 -- -- -- 0.1 -- 0.1 -- 0.36826
3 74.0* 3.1* 22.5* 0.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 -- 0.25790
B 94.0* -- 5.5* 0.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 -- 0.24558
A -- 81.3* 18.7* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --219
C 93.8* -- -- 1.9 -- -- -- -- 4.3* -- -- -- -- -- -- -- --162
E -- -- 99.9 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --1013
M 85.7* 2.4* 5.7* 1.5* 0.6 -- 0.7 0.5 -- 0.3 -- 0.1 0.2 0.1 -- 1.0 1.3880
 
Base Pair (571:865)   (Tertiary) Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.3* 98.8* 0.1 0.1* 0.2 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.16825
3 -- -- 99.7 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --5788
B -- -- 99.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --4553
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --220
C -- -- 98.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 0.6162
E -- -- 99.6 -- -- 0.3 -- -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- --1015
M -- 2.3* 93.0* 0.7* 0.6 0.8 0.7 -- -- 0.1 -- 0.1 0.1 -- 0.1 0.2 1.3881
 

Last generated : Fri Jun 16 2000 (14 : 29)