16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 655
| Base Pair (655:751)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
17.0* |
-- |
0.1* |
70.5* |
0.5 |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
11.1 | 7127 |
| 3 |
20.0* |
-- |
0.1* |
78.8* |
0.6 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 6066 |
| B |
1.2* |
-- |
-- |
98.1* |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 4817 |
| A |
86.9* |
-- |
-- |
11.8* |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 221 |
| C |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 168 |
| E |
93.5* |
0.3* |
0.4* |
2.8* |
1.8 |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 1028 |
| M |
0.1* |
-- |
0.4* |
8.8* |
0.1 |
-- |
0.8 |
2.8 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
86.5 | 901 |
| |
| Base Pair (656:750)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
68.8* |
0.7* |
0.3* |
6.2* |
12.7 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
10.5 | 7121 |
| 3 |
76.8* |
0.8* |
-- |
7.1* |
14.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 6063 |
| B |
91.2* |
0.8* |
-- |
7.5* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 4815 |
| A |
87.8* |
-- |
-- |
9.5* |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 221 |
| C |
97.6* |
-- |
-- |
0.6* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- | 166 |
| E |
6.6 |
1.2* |
-- |
4.7 |
87.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1027 |
| M |
9.1* |
0.4* |
2.2* |
1.0* |
0.1 |
-- |
0.6 |
0.4 |
0.2 |
0.6 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.7 |
0.7 |
83.6 | 900 |
| |
| Base Pair (657:749)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.1 |
0.4* |
64.2* |
6.0 |
12.6* |
0.2 |
0.7 |
0.1* |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
1.3 |
0.1 |
0.2 |
0.7 |
7.8 | 7111 |
| 3 |
5.9 |
0.4* |
69.9* |
6.7 |
14.7* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.4 |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
-- | 6053 |
| B |
4.9* |
0.6* |
88.2* |
2.3* |
1.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.8 |
0.1 |
-- |
0.5 |
-- | 4803 |
| A |
42.1* |
-- |
-- |
57.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 221 |
| C |
2.4* |
-- |
90.9* |
1.8* |
2.4 |
1.2 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 165 |
| E |
2.6 |
-- |
-- |
16.5 |
80.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
0.1 |
-- | 1029 |
| M |
-- |
0.1 |
20.2* |
2.1* |
0.6 |
1.0 |
4.2 |
1.1 |
0.9 |
1.6 |
0.6* |
0.9 |
0.3 |
0.3* |
1.2 |
2.9 |
62.2 | 901 |
| |
| Base Pair (658:748)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.4 |
6.2* |
6.5 |
26.7* |
6.7 |
1.2 |
7.0 |
1.5 |
1.6 |
2.4 |
0.5 |
3.6 |
14.8* |
1.9 |
1.1* |
6.1 |
6.9 | 7004 |
| 3 |
6.2 |
7.2* |
4.8 |
30.5* |
7.5 |
0.6 |
7.8 |
0.8 |
0.4 |
2.4 |
0.5 |
4.1 |
17.1* |
2.1 |
1.2* |
6.7 |
-- | 5948 |
| B |
7.8 |
7.7* |
5.7 |
20.6* |
8.5 |
0.8 |
9.6 |
0.5 |
0.4 |
1.5 |
0.3 |
5.1 |
21.3* |
1.0 |
0.8* |
8.4 |
-- | 4701 |
| A |
-- |
25.1 |
8.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
24.7* |
7.3 |
-- |
-- |
33.3* |
0.5 |
0.9* |
-- | 219 |
| C |
2.4 |
0.6* |
6.0 |
25.6 |
2.4 |
0.6 |
9.5 |
31.0* |
1.2 |
-- |
-- |
3.0 |
7.7* |
3.0 |
-- |
7.1* |
-- | 168 |
| E |
0.5 |
0.8* |
0.1 |
82.3* |
4.8 |
-- |
0.8 |
2.1 |
0.6 |
1.8 |
0.1 |
0.8 |
1.8* |
0.3 |
2.8* |
0.4 |
0.1 | 1028 |
| M |
0.3 |
0.8 |
17.4* |
1.5 |
2.1* |
5.1 |
1.5 |
0.6 |
9.6* |
2.9 |
0.2* |
0.1 |
0.4 |
0.3 |
0.6 |
1.5 |
55.3 | 896 |
| |
|
| Base Pair (659:746)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.1* |
47.0* |
25.9* |
7.0* |
0.6 |
3.1 |
1.3 |
0.5 |
0.4 |
0.6 |
0.4 |
1.9 |
0.2 |
0.1 |
1.5 |
1.2 |
7.0 | 7050 |
| 3 |
1.2* |
53.9* |
27.9* |
7.3* |
0.7 |
3.6 |
0.9 |
0.1 |
0.4 |
0.3 |
0.1 |
2.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
1.1 |
-- | 5994 |
| B |
1.5* |
48.4* |
33.5* |
8.9* |
0.8 |
1.2 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.1 |
2.8 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
1.3 |
-- | 4744 |
| A |
-- |
87.4* |
11.7* |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 222 |
| C |
0.6* |
48.5* |
41.9* |
4.8* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 |
1.2 | 167 |
| E |
0.2* |
72.3* |
5.5* |
1.2* |
-- |
15.3 |
2.9 |
-- |
2.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- | 1028 |
| M |
0.4 |
0.2 |
9.3 |
5.5* |
0.3 |
0.9 |
4.1 |
3.2 |
0.7 |
2.9* |
3.0 |
0.3 |
0.9 |
0.1* |
11.3* |
2.6 |
54.3 | 897 |
| |
| Base Pair (660:745)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
34.9* |
4.4* |
16.1* |
26.3* |
6.7 |
0.3 |
1.1 |
0.8 |
0.2 |
1.0 |
0.7 |
0.4 |
0.2 |
0.1 |
0.6 |
1.3 |
4.8 | 7050 |
| 3 |
38.5* |
5.1* |
17.6* |
29.3* |
7.8 |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
0.3 | 5994 |
| B |
37.7* |
6.3* |
22.2* |
25.0* |
7.2 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 | 4748 |
| A |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 221 |
| C |
79.8* |
0.6* |
1.8* |
15.5* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 | 168 |
| E |
28.8* |
0.6* |
-- |
55.5* |
12.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
2.4 |
0.2 | 1025 |
| M |
2.2 |
0.9 |
8.8* |
8.4* |
0.3 |
0.9 |
7.9 |
5.9 |
1.2 |
7.4 |
4.7* |
2.8 |
0.8 |
0.6* |
4.1 |
6.5 |
36.6 | 896 |
| |
| Base Pair (661:744)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
52.5* |
0.8* |
6.0* |
8.7* |
1.3 |
0.8 |
1.3 |
0.6 |
0.4 |
0.6 |
0.3 |
0.2 |
18.5 |
0.3 |
0.6 |
0.5 |
6.6 | 7105 |
| 3 |
59.2* |
0.8* |
5.8* |
8.4* |
1.4 |
0.8 |
0.2 |
0.3 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
21.6 |
0.3 |
0.4 |
0.1 |
-- | 6049 |
| B |
74.4* |
1.0* |
6.3* |
10.5* |
1.8 |
0.9 |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
3.6 |
0.4 |
0.5 |
0.1 |
-- | 4798 |
| A |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
96.4* |
-- |
-- |
-- |
-- | 222 |
| C |
84.5* |
-- |
1.2 |
8.3* |
-- |
1.8* |
1.2 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 168 |
| E |
0.8 |
0.2 |
4.7 |
0.1 |
-- |
0.5 |
1.4 |
0.4 |
2.3* |
0.1 |
-- |
-- |
89.2* |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 1029 |
| M |
1.1 |
0.6 |
7.9* |
10.5* |
0.7 |
0.3 |
8.5 |
2.6 |
0.6 |
4.2 |
2.0* |
1.2 |
1.0 |
0.1* |
2.1 |
3.2 |
53.3 | 896 |
| |
| Base Pair (662:743)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
9.0 |
9.5 |
11.2 |
11.1* |
1.0 |
28.2* |
3.2 |
1.4 |
1.7 |
1.6 |
0.5* |
0.5 |
15.6* |
0.2 |
0.6 |
0.7 |
3.8 | 7067 |
| 3 |
10.5 |
10.8 |
11.9 |
11.3* |
1.0 |
30.4* |
2.2 |
0.3 |
1.7 |
0.7 |
-- |
0.1 |
18.2* |
0.2 |
0.3 |
0.2 |
-- | 6013 |
| B |
13.0 |
13.2 |
14.4 |
13.6* |
1.0 |
23.1* |
0.5 |
0.1 |
1.2 |
0.3 |
-- |
-- |
18.8* |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- | 4763 |
| A |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
10.0* |
-- |
-- |
-- |
84.6* |
-- |
-- |
-- |
-- | 221 |
| C |
-- |
-- |
8.3 |
1.8* |
-- |
81.5* |
-- |
-- |
3.0 |
3.6* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
0.6 | 168 |
| E |
0.7 |
2.1 |
2.6 |
3.0 |
1.4* |
70.5* |
9.6* |
1.2 |
2.5 |
2.8 |
-- |
0.7 |
0.8 |
0.8 |
0.4 |
0.7 |
0.3 | 1029 |
| M |
1.1* |
2.5 |
6.8 |
11.5* |
0.8 |
3.6* |
10.1 |
9.4 |
1.1 |
7.5* |
4.1 |
3.5 |
1.0 |
0.1 |
2.9 |
4.1 |
29.8 | 894 |
| |
| Base Pair (663:742) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.8 |
5.7 |
4.4* |
1.0 |
0.6* |
7.7 |
2.1 |
1.3 |
69.3* |
0.7 |
0.8* |
0.7 |
0.3 |
0.2 |
0.5 |
1.1 |
2.8 | 7099 |
| 3 |
0.6* |
6.5 |
4.5* |
0.1 |
0.2 |
8.8 |
0.5 |
0.1 |
78.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 6044 |
| B |
0.8* |
0.9 |
2.3* |
0.1 |
0.3 |
0.5 |
0.3 |
0.1 |
94.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 | 4794 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
6.3 |
-- |
92.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 221 |
| C |
-- |
0.6 |
0.6* |
2.4 |
0.6* |
1.2 |
0.6 |
-- |
93.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 168 |
| E |
-- |
33.9 |
15.5 |
0.1 |
-- |
49.5* |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
0.2 |
0.3 |
-- |
0.2 | 1029 |
| M |
2.2 |
1.2 |
4.7 |
6.7 |
3.2 |
1.0 |
13.3* |
9.6 |
4.1 |
5.5 |
6.3* |
5.8 |
1.8 |
0.2* |
4.0 |
8.5* |
21.7 | 895 |
| |
|
| Base Pair (666:740)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.7 |
2.8* |
1.0 |
3.0 |
69.7* |
-- |
2.2* |
0.8 |
0.9 |
0.8 |
0.3 |
0.7 |
13.1 |
-- |
-- |
0.1 |
2.7 | 7111 |
| 3 |
2.0 |
1.0* |
0.1* |
2.4 |
78.8* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
15.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 6055 |
| B |
0.8 |
0.5* |
0.1* |
2.9 |
95.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 4805 |
| A |
32.0 |
16.7* |
0.9* |
0.9 |
49.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 222 |
| C |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
94.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
1.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
6.9 |
-- |
0.1 |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
90.6* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 1028 |
| M |
0.3 |
15.7* |
6.8 |
7.0 |
3.5* |
0.1 |
17.2* |
6.5 |
6.4 |
6.7 |
2.6 |
5.4 |
0.2 |
-- |
-- |
0.8 |
21.0 | 897 |
| |
| Base Pair (667:739)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
85.4* |
0.4* |
10.5* |
2.6* |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 | 7110 |
| 3 |
96.3* |
0.3* |
0.2* |
2.7* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 6051 |
| B |
96.1* |
-- |
-- |
3.4* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4803 |
| A |
86.5* |
7.7* |
5.4* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 222 |
| C |
97.6* |
-- |
-- |
1.2* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
98.9* |
0.2* |
0.1* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 | 1026 |
| M |
9.0* |
1.1* |
81.6* |
2.3* |
0.6 |
0.6 |
0.7 |
0.1 |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
0.8 |
2.1 | 900 |
| |
| Base Pair (668:738)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
30.6* |
7.2* |
16.5* |
41.6* |
1.6 |
1.4 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 | 7106 |
| 3 |
35.6* |
7.0* |
17.9* |
35.6* |
1.8 |
1.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- | 6048 |
| B |
26.2* |
6.6* |
20.1* |
43.9* |
1.1 |
1.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- | 4799 |
| A |
0.9* |
43.7* |
38.3* |
9.5* |
-- |
7.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- | 222 |
| C |
0.6* |
50.6* |
39.8* |
1.2* |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
0.6 | 166 |
| E |
87.2* |
1.0* |
2.9* |
2.6* |
5.8 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 1027 |
| M |
2.3* |
0.4* |
2.6* |
89.0* |
0.8 |
0.1 |
0.2 |
1.3 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.1 |
1.8 | 900 |
| |
| Base Pair (669:737)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
37.2* |
14.8* |
13.0* |
32.4* |
0.5 |
0.8 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 | 7054 |
| 3 |
39.0* |
17.4* |
14.8* |
27.0* |
0.2 |
0.8 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 | 5995 |
| B |
47.1* |
2.6* |
16.4* |
32.1* |
0.2 |
0.9 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 4752 |
| A |
27.3* |
34.1* |
12.3* |
25.5* |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 220 |
| C |
0.6* |
-- |
2.4* |
91.6* |
3.6 |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
3.9* |
82.5* |
7.9* |
3.2* |
0.4 |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.3 | 1023 |
| M |
31.6* |
-- |
3.3* |
57.9* |
1.8 |
0.3 |
0.6 |
1.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 |
0.8 |
1.7 | 900 |
| |
| Base Pair (670:736)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
30.2* |
1.3* |
2.3* |
62.0* |
2.6 |
0.2 |
0.4 |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 | 7057 |
| 3 |
29.3* |
1.4* |
2.3* |
63.6* |
2.7 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 5998 |
| B |
33.2* |
1.2* |
2.3* |
59.3* |
3.3 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4749 |
| A |
50.4* |
-- |
3.1* |
46.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 226 |
| C |
70.7* |
3.0* |
3.0* |
18.0* |
4.2 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
6.8* |
2.6* |
2.2* |
87.4* |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1023 |
| M |
28.1* |
0.1* |
2.8* |
58.4* |
1.9 |
0.1 |
2.7 |
2.7 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.6 |
1.8 | 900 |
| |
| Base Pair (671:735)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
55.6* |
11.3* |
3.6* |
14.5* |
0.3 |
0.2 |
0.2 |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
4.2 |
8.7 |
0.2 | 7070 |
| 3 |
56.4* |
13.2* |
4.1 |
9.8 |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.1 |
4.9 |
10.2* |
0.1 | 6011 |
| B |
68.1* |
16.2* |
5.2* |
9.4* |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 | 4751 |
| A |
62.1* |
9.9* |
-- |
27.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 232 |
| C |
4.2* |
2.4* |
1.2* |
89.2* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
0.9* |
-- |
0.1 |
7.7 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
0.8 |
2.6 |
-- |
-- |
28.2 |
59.5* |
-- | 1028 |
| M |
59.7* |
0.3* |
0.8* |
31.9* |
1.2 |
0.8 |
1.1 |
1.8 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
1.7 | 900 |
| |
| Base Pair (672:734)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.5* |
17.2 |
21.4 |
3.5* |
0.1 |
36.8* |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.7* |
0.1 |
1.0 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
12.5 |
0.3 | 7126 |
| 3 |
3.9* |
17.7 |
16.2 |
2.9* |
-- |
42.6* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
1.2 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
14.5 |
0.1 | 6067 |
| B |
2.6* |
20.7 |
20.3 |
1.4* |
-- |
53.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
0.4 |
0.1 | 4806 |
| A |
45.7* |
18.5* |
-- |
35.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 232 |
| C |
85.6* |
-- |
0.6* |
13.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
0.5* |
3.6* |
0.8 |
3.0 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.4 |
7.0 |
-- |
0.3 |
0.1 |
83.7* |
-- | 1029 |
| M |
1.3* |
16.9* |
59.9* |
6.0* |
0.7 |
4.1 |
1.0 |
0.1 |
0.2 |
5.8 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.2 |
1.0 |
2.1 | 900 |
| |
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