16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 722
| Base Pair (722:733) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2 |
0.7 |
3.0 |
1.6 |
0.9 |
0.7 |
29.5* |
0.3 |
5.1 |
0.4 |
0.1* |
0.1 |
1.3 |
55.1* |
0.1 |
0.2* |
0.7 | 7189 |
| 3 |
0.1 |
-- |
2.1 |
0.1 |
0.7 |
0.1 |
29.7* |
0.1 |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
63.1* |
-- |
-- |
0.1 | 6134 |
| B |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
24.5* |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
71.3* |
-- |
-- |
0.1 | 4860 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
20.3* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
78.4* |
-- |
-- |
-- | 241 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
75.4* |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
21.6* |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
0.1 |
0.1 |
12.2 |
0.3 |
3.3 |
0.1 |
56.2* |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
5.9 |
20.6* |
-- |
-- |
0.3 | 1033 |
| M |
0.2 |
5.2 |
10.2* |
12.1 |
1.8* |
4.4 |
19.3 |
1.9 |
24.0* |
3.3 |
0.9* |
1.0 |
1.2 |
6.0 |
1.1 |
2.8 |
4.5 | 896 |
| |
|
| Base Pair (725:732)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
87.6* |
0.1* |
0.3* |
8.4* |
0.3 |
-- |
0.2 |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.8 |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
0.4 |
0.3 |
0.4 | 7209 |
| 3 |
98.7* |
0.1* |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.3 | 6153 |
| B |
98.7* |
0.1* |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
0.2 | 4877 |
| A |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 241 |
| C |
94.6* |
-- |
0.6* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
0.6 |
-- |
-- |
1.2 | 167 |
| E |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.8 |
-- |
-- |
0.7 | 1035 |
| M |
9.8* |
0.3* |
3.3* |
66.1* |
2.0 |
0.3 |
1.8 |
2.2 |
0.1 |
0.6 |
5.8 |
2.9 |
0.1 |
0.1 |
0.6 |
2.2 |
1.6 | 897 |
| |
| Base Pair (726:731)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7* |
95.0* |
2.5* |
0.3* |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 7219 |
| 3 |
0.8* |
98.3* |
0.2* |
0.1* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 6160 |
| B |
0.8* |
98.4* |
0.2* |
0.1* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 4885 |
| A |
3.3* |
96.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| C |
-- |
94.6* |
1.2* |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 168 |
| E |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 1034 |
| M |
0.3* |
71.1* |
18.2* |
2.4* |
0.8 |
1.1 |
1.3 |
0.4 |
0.1 |
1.9 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
1.3 | 899 |
| |
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