16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 769
| Base Pair (769:810)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
97.9* |
0.2* |
0.3* |
0.6* |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 | 7119 |
| 3 |
99.3* |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 6065 |
| B |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 | 4795 |
| A |
97.4* |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 229 |
| C |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 168 |
| E |
99.7* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 1041 |
| M |
87.5* |
1.5* |
2.0* |
4.7* |
1.3 |
-- |
0.9 |
0.8 |
0.2 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.3 | 894 |
| |
| Base Pair (770:809)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
80.9* |
17.6* |
0.1* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 | 7109 |
| 3 |
0.2* |
79.4* |
19.5* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 | 6054 |
| B |
0.3* |
94.5* |
4.3* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.1 | 4785 |
| A |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 229 |
| C |
-- |
94.6* |
4.8* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 167 |
| E |
-- |
5.6* |
93.8* |
0.3* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 1040 |
| M |
0.4* |
87.4* |
7.9* |
0.3* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
3.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 | 896 |
| |
| Base Pair (771:808)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
58.2* |
4.4* |
27.1* |
8.3* |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 | 7092 |
| 3 |
67.9* |
3.9* |
17.4* |
9.2* |
0.7 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 | 6038 |
| B |
85.2* |
1.2* |
4.5* |
7.4* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.3 | 4772 |
| A |
-- |
49.8* |
48.0* |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 225 |
| C |
6.6* |
1.2* |
87.3* |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 166 |
| E |
2.9* |
6.5* |
70.1* |
19.2* |
0.1 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1041 |
| M |
2.2* |
8.7* |
81.6* |
4.0* |
0.2 |
0.8 |
-- |
-- |
0.1 |
0.8 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
1.0 |
0.2 | 896 |
| |
| Base Pair (772:807)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.9* |
1.3* |
63.9* |
26.8* |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 7122 |
| 3 |
5.2* |
1.5* |
73.4* |
19.5* |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 6067 |
| B |
0.5* |
1.7* |
91.9* |
5.5* |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 4799 |
| A |
49.1* |
3.1* |
1.3* |
45.6* |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 228 |
| C |
4.8* |
-- |
-- |
91.0* |
3.0 |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 167 |
| E |
17.2* |
0.2* |
3.5* |
78.8* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1040 |
| M |
18.9* |
0.7* |
11.6* |
63.8* |
0.8 |
0.2 |
0.6 |
2.0 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.6 |
0.3 | 896 |
| |
| Base Pair (773:806)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
80.7* |
0.1* |
0.2* |
8.7* |
9.6 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- | 7131 |
| 3 |
86.7* |
-- |
-- |
1.9* |
11.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 6074 |
| B |
98.1* |
-- |
-- |
1.5* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 4804 |
| A |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 230 |
| C |
77.2* |
1.2* |
1.2* |
18.6* |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 167 |
| E |
31.4 |
0.1* |
-- |
4.2 |
63.8* |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 1040 |
| M |
40.1* |
0.1* |
1.4* |
52.6* |
1.4 |
0.6 |
0.1 |
1.7 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
0.6 |
0.8 | 898 |
| |
| Base Pair (774:805)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
95.3* |
-- |
0.1* |
4.1* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 7160 |
| 3 |
95.9* |
-- |
-- |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 6104 |
| B |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4835 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 230 |
| C |
95.2* |
-- |
-- |
4.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 167 |
| E |
76.3* |
-- |
-- |
23.5* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1039 |
| M |
91.1* |
-- |
0.4* |
5.1* |
1.3 |
-- |
0.2 |
0.8 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.2 | 897 |
| |
|
| Base Pair (778:804)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
10.4* |
0.2* |
0.8 |
71.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
16.7 |
0.5 | 7148 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
79.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
19.5 |
-- | 6093 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
3.5 |
-- | 4827 |
| A |
-- |
-- |
-- |
19.0 |
66.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6 |
-- | 226 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 167 |
| E |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
94.6 |
0.1 | 1040 |
| M |
0.1 |
82.9* |
1.3* |
1.2 |
8.4* |
0.1 |
-- |
0.1* |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
4.5 | 896 |
| |
| Base Pair (779:803)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
87.1* |
0.9* |
11.2* |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 7200 |
| 3 |
-- |
98.6* |
1.0* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 6109 |
| B |
-- |
99.0* |
0.6* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 4841 |
| A |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 229 |
| C |
-- |
94.0* |
3.0* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 167 |
| E |
-- |
96.4* |
2.7* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 1039 |
| M |
0.3* |
10.0* |
0.4* |
85.7* |
0.4 |
0.3 |
0.2 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 933 |
| |
|
| Base Pair (783:799)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.5* |
66.7* |
14.9* |
2.3* |
1.0 |
-- |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.4 | 7019 |
| 3 |
15.9* |
78.1* |
2.2* |
2.0* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 5925 |
| B |
0.5* |
95.1* |
2.7* |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4657 |
| A |
1.3* |
85.2* |
3.0* |
6.1* |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 230 |
| C |
-- |
4.2* |
76.2* |
14.3* |
-- |
1.2 |
1.8 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 168 |
| E |
88.6* |
0.2* |
0.1* |
4.4* |
6.0 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1038 |
| M |
0.1* |
4.6* |
85.0* |
2.2* |
-- |
-- |
3.5 |
0.2 |
-- |
1.0 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
2.2 | 934 |
| |
| Base Pair (784:798)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.0* |
4.1* |
0.1* |
76.7* |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.3 | 7206 |
| 3 |
7.2* |
4.5* |
-- |
87.7* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 6113 |
| B |
5.2* |
1.9* |
0.1* |
92.5* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4842 |
| A |
17.8* |
78.7* |
-- |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 230 |
| C |
81.5* |
-- |
-- |
18.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 168 |
| E |
14.4* |
0.1* |
-- |
84.1* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- | 1041 |
| M |
76.6* |
1.9* |
0.5* |
16.1* |
0.9 |
-- |
0.9 |
0.6 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
2.1 | 933 |
| |
| Base Pair (785:797)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
84.7* |
11.9* |
1.5* |
0.5* |
-- |
0.8 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.4 | 7215 |
| 3 |
82.7* |
14.0* |
1.8* |
0.2* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 6120 |
| B |
99.5* |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 | 4852 |
| A |
99.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 | 230 |
| C |
97.6* |
-- |
-- |
1.8* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 168 |
| E |
0.5* |
82.7* |
10.6* |
0.1* |
-- |
5.5 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1038 |
| M |
95.5* |
-- |
0.1* |
2.0* |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 935 |
| |
| Base Pair (786:796)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
99.4* |
-- |
-- |
0.1* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 7208 |
| 3 |
99.8* |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 6114 |
| B |
99.7* |
-- |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4850 |
| A |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 226 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 168 |
| E |
99.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1038 |
| M |
97.4 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 934 |
| |
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