16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 861
| Base Pair (861:868)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
70.9* |
2.2* |
1.6 |
0.9 |
5.6 |
0.1 |
3.1* |
0.6 |
-- |
2.4 |
3.9 |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.4* |
7.5 | 6998 |
| 3 |
83.1* |
2.1* |
-- |
0.1 |
6.8 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
4.3 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.3* |
2.3 | 5743 |
| B |
80.3* |
2.6* |
-- |
-- |
7.5 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
5.5 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
3.0 | 4493 |
| A |
83.1 |
-- |
-- |
-- |
16.0 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 231 |
| C |
89.6* |
-- |
-- |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.8 | 164 |
| E |
95.3* |
0.6* |
-- |
0.6 |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.7* |
-- | 1019 |
| M |
4.1* |
2.8* |
10.3 |
4.8 |
0.1 |
0.5 |
19.6* |
0.8 |
0.1 |
15.1 |
1.6 |
1.4 |
1.1 |
-- |
0.3 |
1.0* |
36.2 | 1096 |
| |
| Base Pair (862:867)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
9.9* |
54.3* |
7.7* |
8.0* |
0.2 |
4.1 |
4.6 |
0.3 |
0.3 |
1.7 |
1.2 |
0.7 |
0.4 |
3.5 |
0.6 |
0.6 |
2.1 | 7019 |
| 3 |
12.1* |
62.9* |
5.6* |
9.4* |
0.1 |
4.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.2 |
-- |
-- |
1.1 | 5759 |
| B |
1.0* |
79.4* |
6.9* |
0.1* |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.3 |
-- |
-- |
1.4 | 4510 |
| A |
89.2* |
3.9* |
3.9* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 231 |
| C |
-- |
88.5* |
5.5* |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.8 |
-- |
-- |
-- | 165 |
| E |
43.7* |
3.2* |
0.2* |
52.0* |
0.8 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1018 |
| M |
-- |
3.6 |
19.5 |
1.6 |
0.3 |
3.6 |
29.6* |
1.6 |
1.2 |
10.5 |
7.4* |
4.3 |
2.4 |
0.1* |
3.5 |
4.1* |
6.5 | 1100 |
| |
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