16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 960
| Base Pair (960:975)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
61.8* |
14.8* |
-- |
22.4 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.3 | 6871 |
| 3 |
-- |
-- |
72.2 |
-- |
-- |
27.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 5561 |
| B |
-- |
-- |
92.1 |
-- |
-- |
7.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4347 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 208 |
| C |
-- |
-- |
96.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
-- | 162 |
| E |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 1006 |
| M |
-- |
-- |
6.5* |
89.1* |
-- |
0.6 |
0.9 |
0.3 |
0.6 |
-- |
0.1* |
0.3 |
-- |
-- |
1.0 |
0.7 |
0.1 | 1153 |
| |
| Base Pair (961:974)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
0.1 |
66.4* |
0.1 |
0.1 |
16.8 |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 |
2.1* |
-- |
-- |
8.7 |
4.1 |
0.3 | 6856 |
| 3 |
0.1 |
0.1 |
68.1* |
-- |
-- |
20.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
8.9 |
1.5 |
0.3 | 5546 |
| B |
0.1* |
-- |
86.4* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
11.3 |
1.2 |
0.4 | 4330 |
| A |
-- |
3.3 |
3.3 |
-- |
-- |
78.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.8 |
-- | 209 |
| C |
-- |
-- |
96.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 163 |
| E |
-- |
0.1 |
2.4 |
-- |
-- |
96.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- | 1007 |
| M |
0.6* |
-- |
54.6* |
0.6 |
0.4 |
0.1 |
1.5 |
0.1 |
-- |
3.3 |
0.3 |
12.3* |
0.1 |
-- |
8.9 |
17.3 |
-- | 1151 |
| |
| Base Pair (962:973)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.1* |
80.5* |
0.5* |
-- |
-- |
15.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 | 6863 |
| 3 |
3.8* |
77.0* |
0.1* |
-- |
-- |
18.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 5552 |
| B |
0.2* |
97.9* |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 4339 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
| C |
-- |
95.7* |
1.8* |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 163 |
| E |
-- |
2.2 |
0.5 |
-- |
-- |
97.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 1007 |
| M |
0.3* |
95.7* |
1.9* |
0.1* |
0.1 |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1151 |
| |
| Base Pair (963:972)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 6866 |
| 3 |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 5549 |
| B |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 4342 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 201 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 163 |
| E |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 1006 |
| M |
99.9 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 1153 |
| |
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