16S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 984
| Base Pair (984:1221)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
99.5* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 6849 |
| 3 |
-- |
99.7* |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 5541 |
| B |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4327 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
-- |
99.4* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 161 |
| E |
-- |
99.3* |
0.4* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 1010 |
| M |
-- |
98.6* |
0.2* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.3 |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 1152 |
| |
| Base Pair (985:1220)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
97.9* |
1.1* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 6767 |
| 3 |
0.4* |
98.7* |
0.5* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 | 5460 |
| B |
-- |
99.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 4252 |
| A |
-- |
98.0* |
0.5* |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 196 |
| C |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 161 |
| E |
2.1* |
94.5* |
2.4* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 | 1008 |
| M |
-- |
93.7* |
5.1* |
0.2* |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 1151 |
| |
| Base Pair (986:1219)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.2* |
4.4* |
31.0* |
58.9* |
0.2 |
0.3 |
0.1 |
0.7 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.4 |
-- | 6840 |
| 3 |
2.3* |
4.6* |
36.0* |
56.2* |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.1 | 5533 |
| B |
0.4* |
4.0* |
45.9* |
48.9* |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 4321 |
| A |
48.7* |
9.1* |
2.5* |
37.1* |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 197 |
| C |
0.6* |
-- |
-- |
98.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 161 |
| E |
1.5* |
6.0* |
-- |
91.2* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.3 | 1010 |
| M |
7.7* |
4.3* |
12.4* |
65.8* |
0.7 |
1.4 |
0.2 |
3.3 |
-- |
0.4 |
1.0 |
1.2 |
-- |
-- |
0.2 |
1.3 |
-- | 1151 |
| |
| Base Pair (987:1218)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
55.2* |
8.7* |
5.7* |
27.3* |
0.8 |
0.2 |
0.3 |
0.2 |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 | 6832 |
| 3 |
64.9* |
1.0* |
0.9* |
31.6* |
0.8 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.1 | 5525 |
| B |
56.6* |
1.3* |
1.2* |
39.9* |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 4310 |
| A |
94.9* |
-- |
-- |
0.5* |
4.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
89.4* |
-- |
-- |
9.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- | 161 |
| E |
94.7* |
-- |
-- |
2.7* |
0.8 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
1.3 |
-- |
-- |
0.1 | 1010 |
| M |
3.8* |
46.6* |
30.3* |
9.3* |
1.0 |
1.5 |
1.4 |
0.6 |
0.4 |
3.0 |
0.5 |
0.5 |
0.3 |
-- |
0.3 |
0.2 |
0.1 | 1151 |
| |
| Base Pair (988:1217)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
48.3* |
24.8* |
8.9* |
3.4* |
12.4 |
0.6 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.7 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.1 | 6852 |
| 3 |
57.3* |
23.2* |
1.1* |
2.3* |
14.9 |
0.4 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.1 | 5544 |
| B |
65.4* |
28.5* |
0.5* |
2.1* |
2.7 |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- | 4333 |
| A |
67.7* |
15.2* |
5.1* |
9.1* |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
80.1* |
-- |
1.9* |
8.7* |
7.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.2 |
-- | 161 |
| E |
20.7 |
2.2* |
3.1* |
2.1 |
69.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
0.1 | 1008 |
| M |
0.5* |
35.7* |
47.0* |
8.7* |
0.8 |
2.0 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
4.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.1 | 1152 |
| |
| Base Pair (989:1216)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
9.6 |
18.3* |
26.1* |
6.6 |
22.1* |
2.2 |
0.1 |
0.1* |
-- |
0.9 |
0.2 |
2.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
10.9 |
0.2 | 6812 |
| 3 |
9.3 |
16.5* |
21.6* |
6.8 |
26.9* |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
2.9 |
0.1 |
0.1 |
-- |
13.3 |
0.3 | 5504 |
| B |
10.0 |
20.6* |
26.2* |
7.3 |
32.9* |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 | 4294 |
| A |
39.4* |
7.6* |
10.6* |
22.7* |
19.2 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
66.5* |
-- |
1.2* |
21.7* |
10.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 161 |
| E |
0.5 |
0.7 |
4.0 |
2.0 |
2.8 |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.1* |
15.8 |
-- |
-- |
0.2 |
72.1* |
0.2 | 1007 |
| M |
2.6* |
29.7* |
51.6* |
3.5* |
0.6 |
4.3 |
0.4 |
0.2 |
0.1 |
5.0 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
1.6 |
-- | 1152 |
| |
| Base Pair (990:1215)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.0* |
78.8* |
6.9* |
0.3* |
-- |
10.6 |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 | 6833 |
| 3 |
2.4* |
80.4* |
4.0* |
0.4* |
-- |
11.6 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 | 5528 |
| B |
-- |
80.6* |
4.4* |
-- |
-- |
14.0 |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 4321 |
| A |
68.2* |
12.1* |
-- |
10.1* |
-- |
7.6 |
-- |
0.5 |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
| C |
-- |
60.9* |
33.5* |
-- |
-- |
1.9 |
2.5 |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 161 |
| E |
-- |
93.2* |
3.2* |
-- |
-- |
1.9 |
0.4 |
-- |
-- |
0.5 |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 1004 |
| M |
-- |
73.2* |
17.1* |
0.7* |
-- |
7.0 |
0.3 |
-- |
0.5 |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.2 | 1149 |
| |
Last generated : Fri Jun 16 2000 (14 : 29)