16S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1074


Base Pair (1074:1083)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 27 71 16 0.33 0.88 0.98 1.86 0.14 0.97 1.16 1.11 0.00 0.82 7016
3 3 6 1 0.22 0.86 1.00 1.86 0.01 0.97 1.79 1.78 0.00 0.79 5705
B 2 3 0 0.00 0.54 1.00 1.54 0.00 1.00 1.95 1.96 0.00 0.77 4489
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.33 1.09 1.09 0.00 0.75 199
C 2 5 1 0.29 0.17 0.00 0.17 0.03 0.99 1.91 1.80 0.00 0.90 163
E 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 1.96 1.85 0.00 0.95 1013
M 22 60 14 0.34 0.55 0.90 1.45 0.85 0.93 1.09 0.91 0.00 0.99 1153
 
Base Pair (1075:1082)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 85 92 55 0.62 0.87 0.95 1.82 0.85 0.97 0.60 0.56 0.00 0.82 7030
3 26 33 21 0.71 0.89 0.97 1.85 0.85 1.00 0.80 0.74 0.00 0.80 5720
B 18 19 18 0.97 0.98 1.00 1.97 1.00 1.00 1.51 1.51 0.00 0.77 4501
A 1 4 0 0.00 0.74 0.95 1.69 0.95 0.95 1.37 1.30 0.00 0.76 201
C 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.95 0.95 0.00 0.90 164
E 7 10 3 0.35 0.11 0.00 0.11 0.18 1.00 1.60 1.29 0.00 0.96 1014
M 55 55 30 0.55 0.78 0.88 1.66 0.81 0.86 0.49 0.43 0.00 0.99 1151
 
Base Pair (1076:1081)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 110 103 60 0.56 0.90 0.96 1.86 0.96 0.99 0.64 0.71 0.00 0.82 7021
3 34 34 26 0.77 0.94 0.98 1.92 0.98 1.00 0.79 0.82 0.00 0.79 5710
B 20 19 12 0.61 0.81 0.98 1.79 0.98 1.00 1.46 1.51 0.00 0.77 4492
A 5 6 5 0.91 0.99 0.99 1.98 0.99 0.99 1.04 1.04 0.00 0.76 201
C 8 8 8 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.26 1.26 0.00 0.90 164
E 9 9 9 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.31 1.29 0.00 0.96 1013
M 68 61 26 0.40 0.74 0.86 1.61 0.86 0.97 0.67 0.77 0.02 0.97 1152
 

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