16S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1113


Base Pair (1113:1187)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 80 39 18 0.30 0.60 0.93 1.53 0.93 0.95 1.11 1.12 0.00 0.81 6931
3 11 6 3 0.35 0.13 0.00 0.13 0.97 1.00 1.75 1.93 0.00 0.78 5622
B 3 1 1 0.50 0.25 0.00 0.25 1.00 1.00 1.98 1.98 0.00 0.75 4403
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.75 197
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.95 2.00 0.00 0.90 163
E 8 5 2 0.31 0.13 0.00 0.13 0.84 1.00 1.24 1.80 0.00 0.96 1018
M 68 33 15 0.30 0.62 0.71 1.33 0.71 0.72 -0.04 0.12 0.00 0.98 1151
 
Base Pair (1114:1186)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 76 66 36 0.51 0.82 0.95 1.77 0.95 0.95 0.76 0.72 0.00 0.82 6978
3 18 14 9 0.56 0.79 0.97 1.76 0.97 0.97 1.38 1.33 0.00 0.79 5668
B 3 2 0 0.00 0.07 0.00 0.07 1.00 1.00 1.95 1.98 0.00 0.76 4450
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.75 197
C 2 1 1 0.67 0.67 0.99 1.66 0.99 0.99 1.85 1.91 0.00 0.90 163
E 14 11 8 0.64 0.44 0.83 1.27 0.83 0.85 1.00 1.22 0.00 0.96 1016
M 56 51 26 0.49 0.77 0.86 1.63 0.86 0.86 0.16 0.36 0.00 0.98 1152
 
Base Pair (1115:1185)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 213 153 65 0.35 0.22 0.63 0.85 0.45 0.98 0.66 0.82 0.00 0.82 7041
3 121 62 20 0.22 0.24 0.72 0.96 0.36 0.99 0.73 1.15 0.00 0.80 5731
B 96 39 11 0.16 0.13 0.00 0.13 0.28 1.00 1.03 1.51 0.00 0.77 4512
A 6 6 4 0.67 0.96 0.98 1.95 0.98 0.99 0.37 0.39 0.00 0.75 198
C 7 12 4 0.42 0.25 0.82 1.07 0.82 0.97 1.58 1.02 0.00 0.91 165
E 19 17 5 0.28 0.33 0.59 0.92 0.58 0.96 0.40 0.55 0.00 0.96 1016
M 85 79 41 0.50 0.74 0.86 1.60 0.86 0.90 0.34 0.41 0.00 0.98 1150
 
Base Pair (1116:1184)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 116 65 25 0.28 0.32 0.70 1.02 0.40 0.97 -0.20 0.29 0.00 0.68 6838
3 95 41 18 0.27 0.35 0.72 1.07 0.38 0.98 0.46 1.07 0.00 0.77 5526
B 68 14 2 0.05 0.00 0.00 0.00 0.27 1.00 1.12 1.94 0.00 0.73 4307
A 6 6 3 0.50 0.10 0.00 0.10 0.52 0.69 1.14 0.98 0.00 0.75 197
C 11 7 3 0.33 0.23 0.63 0.86 0.63 0.99 0.92 1.46 0.00 0.91 165
E 21 21 13 0.62 0.65 0.84 1.50 0.84 0.95 0.54 0.56 0.00 0.96 1017
M 10 17 4 0.30 0.41 0.71 1.12 0.71 0.79 -0.45 -0.51 0.01 0.12 1152
 

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