16S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 113


Base Pair (113:314)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 8 7 0.74 0.98 1.00 1.98 1.00 1.00 1.26 1.27 0.00 0.81 6916
3 9 6 6 0.80 0.99 1.00 1.99 1.00 1.00 1.23 1.26 0.00 0.82 5931
B 5 4 4 0.89 0.83 1.00 1.83 1.00 1.00 1.90 1.92 0.00 0.81 4720
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.97 2.00 1.85 0.00 0.77 203
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.95 1.95 0.00 0.90 164
E 4 2 2 0.67 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.96 2.00 0.00 0.95 1008
M 1 1 0 0.00 0.54 0.99 1.53 0.99 0.99 1.64 1.60 0.01 0.69 830
 
Base Pair (114:313)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 9 9 0.90 0.65 0.99 1.64 0.99 1.00 1.85 1.86 0.00 0.81 6906
3 6 6 6 1.00 0.74 1.00 1.74 1.00 1.00 1.88 1.90 0.00 0.82 5921
B 5 6 6 1.00 0.83 1.00 1.83 1.00 1.00 1.86 1.88 0.00 0.80 4704
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.97 2.00 1.85 0.00 0.77 204
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.95 2.00 0.00 0.90 164
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 2.00 0.00 0.96 1013
M 4 3 3 0.86 0.29 0.98 1.27 0.98 0.98 1.67 1.60 0.01 0.70 830
 
Base Pair (115:312)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 19 18 12 0.65 0.97 0.99 1.96 0.99 1.00 1.22 1.21 0.00 0.80 6856
3 16 17 12 0.73 0.98 0.99 1.97 0.99 1.00 1.18 1.19 0.00 0.82 5871
B 8 11 7 0.74 0.79 1.00 1.78 1.00 1.00 1.85 1.84 0.00 0.79 4659
A 3 3 3 1.00 0.88 0.97 1.86 0.97 0.97 1.31 1.20 0.00 0.77 203
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.95 2.00 0.00 0.90 164
E 5 3 2 0.50 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.95 1.98 0.00 0.96 1009
M 2 1 0 0.00 0.25 0.98 1.23 0.98 0.98 1.69 1.58 0.01 0.70 830
 

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