16S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 17


Base Pair (17:918)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 13 16 7 0.48 0.15 0.00 0.15 0.99 0.99 1.92 1.90 0.00 0.46 3912
3 3 6 1 0.22 0.05 0.00 0.05 0.99 0.99 1.94 1.92 0.00 0.43 3123
B 1 3 0 0.00 0.07 0.00 0.07 0.99 0.99 1.95 1.96 0.00 0.37 2163
A 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 2.00 1.93 0.00 0.56 148
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 1.93 0.01 0.64 117
E 2 2 1 0.50 0.04 0.00 0.04 0.97 0.99 1.91 1.81 0.00 0.77 812
M 10 10 6 0.60 0.38 0.98 1.36 0.98 0.99 1.82 1.83 0.00 0.58 672
 
Base Pair (18:917)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 44 41 21 0.49 0.62 0.97 1.60 0.97 0.98 1.62 1.59 0.00 0.46 3930
3 27 23 11 0.44 0.56 0.97 1.53 0.97 0.98 1.68 1.66 0.00 0.44 3137
B 24 18 10 0.48 0.64 0.98 1.62 0.98 0.99 1.70 1.75 0.00 0.37 2163
A 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.94 1.96 0.00 0.56 149
C 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.94 1.93 0.01 0.65 118
E 2 5 1 0.29 0.50 0.93 1.43 0.93 0.93 1.58 1.34 0.00 0.78 825
M 16 17 10 0.61 0.86 0.99 1.85 0.99 0.99 1.39 1.35 0.00 0.58 675
 
Base Pair (19:916)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 49 31 7 0.17 0.71 0.96 1.67 0.96 0.96 1.38 1.41 0.00 0.46 3959
3 32 16 1 0.04 0.72 0.96 1.68 0.96 0.96 1.39 1.41 0.00 0.44 3166
B 32 13 1 0.04 0.72 0.94 1.66 0.94 0.95 1.29 1.34 0.00 0.37 2190
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 1.96 0.00 0.57 150
C 5 2 1 0.29 0.00 0.00 0.00 0.92 0.92 1.40 1.93 0.00 0.64 117
E 0 3 0 0.00 0.83 0.99 1.83 0.99 0.99 1.82 1.79 0.00 0.78 826
M 12 13 5 0.40 0.75 0.98 1.73 0.98 0.98 1.46 1.52 0.00 0.58 676
 

Last generated : Fri Jun 16 2000 (14 : 29)