16S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 184


Base Pair (184:193)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 303 291 144 0.48 0.76 0.82 1.58 0.82 0.94 -0.81 -0.73 0.00 0.61 7034
3 292 277 142 0.50 0.77 0.84 1.61 0.84 0.94 -0.66 -0.56 0.00 0.69 6041
B 271 262 137 0.51 0.81 0.87 1.68 0.87 0.95 -0.07 0.05 0.00 0.81 4800
A 21 15 5 0.28 0.25 0.47 0.72 0.16 0.50 0.36 0.50 0.00 0.81 214
C 6 5 0 0.00 0.10 0.00 0.10 0.46 0.99 1.17 0.69 0.00 0.92 169
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1028
M 5 9 2 0.29 0.03 0.00 0.03 0.08 0.08 -0.45 -0.43 0.00 0.00 832
 
Base Pair (185:192)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 273 259 150 0.56 0.80 0.89 1.68 0.89 0.97 -0.60 -0.55 0.01 0.61 7065
3 260 244 139 0.55 0.79 0.88 1.68 0.88 0.97 -0.42 -0.37 0.01 0.69 6072
B 246 231 126 0.53 0.79 0.88 1.67 0.88 0.97 0.23 0.33 0.01 0.81 4829
A 14 13 13 0.96 0.91 0.95 1.86 0.95 0.96 0.15 0.13 0.00 0.82 216
C 6 6 6 1.00 0.87 0.99 1.85 0.99 0.99 1.39 1.39 0.00 0.92 169
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1028
M 7 9 5 0.62 0.06 0.00 0.06 0.09 0.09 -0.45 -0.48 0.00 0.00 832
 
Base Pair (186:191)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 177 136 82 0.52 0.66 0.91 1.57 0.91 0.98 -0.25 -0.06 0.00 0.61 7040
3 159 118 70 0.51 0.62 0.91 1.53 0.91 0.98 0.04 0.30 0.01 0.69 6048
B 157 114 70 0.52 0.62 0.91 1.52 0.91 0.98 0.73 1.09 0.01 0.81 4806
A 2 4 0 0.00 0.67 0.98 1.65 0.98 0.99 1.75 1.67 0.00 0.81 215
C 9 9 7 0.78 0.74 0.94 1.68 0.94 0.99 1.09 0.99 0.00 0.91 168
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1028
M 9 9 5 0.56 0.04 0.00 0.04 0.08 0.09 -0.44 -0.46 0.00 0.00 832
 

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