16S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 567


Base Pair (567:883)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 21 28 12 0.49 0.97 0.99 1.96 0.99 1.00 1.33 1.31 0.00 0.79 6761
3 11 10 5 0.48 0.98 1.00 1.97 1.00 1.00 1.29 1.30 0.00 0.80 5721
B 3 1 1 0.50 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.99 1.98 0.00 0.77 4511
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.93 1.93 0.00 0.81 213
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.89 162
E 7 8 3 0.40 0.54 0.98 1.52 0.98 0.99 1.80 1.76 0.00 0.94 997
M 10 18 7 0.50 0.72 0.99 1.71 0.99 0.99 1.73 1.59 0.00 0.76 884
 
Base Pair (568:882)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 17 25 9 0.43 0.64 0.95 1.59 0.95 0.95 1.38 1.53 0.00 0.79 6764
3 9 12 5 0.48 0.64 0.94 1.59 0.94 0.95 1.32 1.50 0.00 0.80 5727
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.94 1.97 0.00 0.77 4516
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.80 212
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.89 162
E 9 12 5 0.48 0.36 0.70 1.06 0.70 0.70 1.14 0.81 0.00 0.95 999
M 8 13 4 0.38 0.53 0.99 1.52 0.99 0.99 1.85 1.81 0.00 0.76 881
 
Base Pair (569:881)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 47 57 28 0.54 0.95 0.99 1.94 0.99 0.99 1.02 1.02 0.00 0.79 6740
3 29 31 18 0.60 0.96 0.99 1.95 0.99 0.99 0.98 0.98 0.00 0.79 5704
B 19 22 11 0.54 0.88 0.99 1.86 0.99 0.99 1.58 1.56 0.00 0.77 4484
A 5 4 4 0.89 0.97 0.99 1.97 0.99 1.00 1.39 1.32 0.00 0.83 219
C 1 3 1 0.50 0.80 0.99 1.79 0.99 0.99 1.84 1.78 0.00 0.89 161
E 5 5 3 0.60 0.27 0.99 1.26 0.99 1.00 1.94 1.89 0.00 0.95 1001
M 17 23 9 0.45 0.82 0.98 1.80 0.98 0.99 1.42 1.36 0.00 0.76 881
 

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