16S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 861

Base Pair (861:868)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 171 108 19 0.14 0.26 0.83 1.09 0.82 0.88 0.65 0.83 0.04 0.76 6998
3 65 45 7 0.13 0.17 0.00 0.17 0.87 0.94 1.35 1.46 0.02 0.78 5743
B 60 35 6 0.13 0.15 0.00 0.15 0.85 0.93 1.27 1.42 0.02 0.74 4493
A 0 5 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 1.00 1.91 1.36 0.00 0.87 231
C 8 2 2 0.40 0.21 0.93 1.15 0.93 0.93 1.30 1.87 0.02 0.89 164
E 5 5 1 0.20 0.48 0.97 1.46 0.96 0.98 1.76 1.71 0.00 0.97 1019
M 98 61 10 0.13 0.18 0.00 0.18 0.35 0.36 -0.79 -0.02 0.18 0.60 1096
 
Base Pair (862:867)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 265 138 70 0.35 0.58 0.81 1.40 0.81 0.86 0.23 0.46 0.01 0.81 7019
3 122 64 47 0.51 0.76 0.91 1.67 0.91 0.95 0.40 0.76 0.01 0.79 5759
B 99 42 25 0.35 0.42 0.89 1.31 0.89 0.94 0.97 1.54 0.01 0.76 4510
A 7 7 7 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.33 1.33 0.00 0.88 231
C 7 3 2 0.40 0.47 0.94 1.41 0.94 0.95 1.37 1.70 0.00 0.91 165
E 16 15 15 0.97 0.98 0.99 1.97 0.99 1.00 0.81 0.81 0.00 0.97 1018
M 136 71 21 0.20 0.18 0.00 0.18 0.27 0.31 -0.05 0.35 0.03 0.89 1100
 
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