16S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 996

Base Pair (996:1045)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 29 37 15 0.46 0.07 0.00 0.07 0.03 0.03 0.19 0.62 0.00 0.00 6974
3 21 22 13 0.60 0.66 0.98 1.64 0.05 0.05 0.56 0.47 0.03 0.62 5664
B 21 22 13 0.60 0.66 0.98 1.64 0.05 0.05 1.68 1.61 0.00 0.76 4429
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 0.00 202
C 1 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.02 1.56 1.71 0.02 0.86 162
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 1029
M 7 13 2 0.20 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.39 1.35 0.00 0.00 1153
 
Base Pair (997:1044)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 23 35 9 0.31 0.34 0.94 1.27 0.94 0.98 0.21 0.08 0.00 0.55 6992
3 11 27 6 0.32 0.38 0.95 1.32 0.95 1.00 0.62 0.41 0.00 0.62 5682
B 11 27 6 0.32 0.38 0.95 1.32 0.95 1.00 1.73 1.47 0.00 0.76 4446
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 204
C 3 2 0 0.00 0.21 0.93 1.15 0.91 0.91 1.51 1.67 0.00 0.89 162
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1029
M 9 6 3 0.40 0.01 0.00 0.01 0.03 0.04 -0.38 -0.30 0.00 0.00 1153
 
Base Pair (998:1043)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 166 165 130 0.79 0.84 0.91 1.75 0.91 0.98 -0.73 -0.76 0.00 0.55 6982
3 138 141 111 0.80 0.84 0.91 1.75 0.91 0.98 -0.53 -0.57 0.00 0.62 5673
B 138 141 111 0.80 0.84 0.91 1.75 0.91 0.98 0.27 0.23 0.00 0.76 4437
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 204
C 17 16 12 0.73 0.81 0.95 1.76 0.95 0.95 0.69 0.83 0.01 0.86 161
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1029
M 11 8 7 0.74 0.01 0.00 0.01 0.06 0.06 -0.33 -0.30 0.00 0.00 1153
 
Base Pair (999:1041)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 203 190 117 0.59 0.80 0.89 1.69 0.89 0.94 -0.79 -0.73 0.00 0.54 6970
3 184 171 106 0.60 0.80 0.89 1.69 0.89 0.94 -0.60 -0.54 0.00 0.61 5660
B 184 171 106 0.60 0.80 0.89 1.69 0.89 0.94 0.17 0.26 0.00 0.75 4424
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 204
C 13 13 7 0.54 0.80 0.90 1.70 0.90 0.92 0.26 0.33 0.00 0.86 162
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1029
M 6 6 4 0.67 0.01 0.00 0.01 0.04 0.04 -0.32 -0.26 0.00 0.00 1153
 
Base Pair (1000:1040)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 216 219 149 0.69 0.87 0.93 1.80 0.93 0.95 -0.78 -0.75 0.00 0.55 6976
3 197 199 137 0.69 0.87 0.93 1.80 0.93 0.95 -0.60 -0.56 0.00 0.62 5666
B 197 199 137 0.69 0.87 0.93 1.80 0.93 0.95 0.18 0.23 0.00 0.76 4433
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 204
C 12 14 7 0.54 0.81 0.93 1.73 0.93 0.95 0.69 0.69 0.00 0.87 162
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1029
M 7 6 5 0.77 0.03 0.00 0.03 0.04 0.04 -0.33 -0.27 0.00 0.00 1153
 
Base Pair (1001:1039)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 286 263 189 0.69 0.85 0.89 1.74 0.89 0.97 -0.89 -0.86 0.00 0.54 6948
3 267 244 177 0.69 0.84 0.89 1.73 0.89 0.97 -0.72 -0.68 0.00 0.61 5638
B 267 244 177 0.69 0.84 0.89 1.73 0.89 0.97 0.03 0.07 0.00 0.75 4405
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 204
C 15 17 11 0.69 0.81 0.89 1.70 0.89 0.93 0.12 0.18 0.00 0.87 162
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1029
M 4 2 1 0.33 0.02 0.00 0.02 0.04 0.04 -0.29 -0.22 0.00 0.00 1153
 
Base Pair (1002:1038)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 254 261 167 0.65 0.84 0.89 1.73 0.89 0.98 -0.87 -0.90 0.00 0.54 6955
3 224 241 153 0.66 0.84 0.89 1.73 0.89 0.98 -0.69 -0.72 0.00 0.61 5645
B 224 241 153 0.66 0.84 0.89 1.73 0.89 0.98 0.09 0.02 0.00 0.75 4412
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 204
C 23 16 10 0.51 0.54 0.81 1.35 0.81 0.92 0.36 0.53 0.01 0.87 162
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1029
M 7 4 4 0.73 0.01 0.00 0.01 0.04 0.04 -0.30 -0.23 0.00 0.00 1153
 
Base Pair (1003:1037)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 116 155 72 0.53 0.51 0.82 1.32 0.82 0.94 -0.34 -0.58 0.00 0.54 6956
3 103 137 64 0.53 0.47 0.80 1.27 0.81 0.94 -0.05 -0.35 0.00 0.61 5646
B 103 137 64 0.53 0.47 0.80 1.27 0.81 0.94 0.90 0.49 0.00 0.75 4413
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 204
C 11 13 7 0.58 0.66 0.86 1.52 0.86 0.95 0.52 0.36 0.01 0.87 162
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1029
M 2 5 1 0.29 0.01 0.00 0.01 0.02 0.02 -0.25 -0.21 0.00 0.00 1153
 
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