16S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 118


 
Base Pair (118:288) Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1* -- 87.6* 5.6* 0.4 0.7 1.9 0.3 -- 0.1 -- -- 1.7 0.1 0.2 0.3 1.0 6943
3 -- -- 97.1* -- -- 0.2 0.1 -- -- 0.1 -- -- 1.7 0.1* 0.1 -- 0.6 5955
B -- -- 97.3 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- -- 2.2 -- 0.1 -- 0.2 4739
A -- -- 97.5 -- -- 2.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 203
C -- -- 93.4* -- 0.6* -- 0.6 -- -- -- -- -- 4.8 -- -- -- 0.6 167
E -- -- 95.8* -- -- 0.5 0.2 -- -- -- -- -- 0.1 0.4* 0.2 -- 2.9 1013
M 0.6* -- 17.3* 46.5* 3.1 4.2 15.5 2.4 -- 0.2 -- 0.1 1.0 -- 1.3 2.7 4.9 830
 
Base Pair (119:287) Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 0.2 97.6* 0.1 -- 0.4 0.2 0.1 -- -- 0.1 0.2* -- -- 0.2 0.8 6810
3 -- -- -- 99.0* 0.1 -- 0.3 0.1 0.1 -- -- -- 0.2* -- -- -- 0.2 5821
B -- -- -- 99.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.3 4603
A -- -- -- 99.5 0.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 205
C -- -- 0.6 98.2* -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6* 0.6 -- -- -- 167
E -- -- -- 96.1* 0.1 -- 1.7 0.6 0.2 -- 0.1* -- 1.2* -- -- -- 0.1 1013
M -- -- 1.3* 87.0* 0.8 -- 1.1 0.7 0.1 0.4 0.1* 0.4 0.1 0.2* 0.2 1.3 6.1 831


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