23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1056
| Base Pair (1056:1082)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.4 | -- |
0.7 | 14.8 |
41.0* | 0.2* |
1.4 | 25.1* | 0.2 | 1.2* |
-- | 0.6 | 0.9 | 0.1 |
0.5 | 1.5 | 8.3 | 863 |
| 3 |
5.7 | -- |
-- | 3.1 |
49.3* | -- |
-- | 40.9* | -- | -- |
-- | -- | -- | 0.2 |
0.4 | -- | 0.4 | 489 |
| B |
0.8 | -- |
-- | 4.5 |
94.2 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 0.4 |
-- | -- | -- | 243 |
| A |
38.9* | -- |
-- | 8.3* |
33.3 | -- |
-- | 16.7 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
2.8 | -- | -- | 36 |
| C |
-- | -- |
-- | 14.0 |
86.0 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 100 |
| E |
5.7 | -- |
-- | 0.5 |
-- | -- |
-- | 92.4 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
0.5 | -- | 1.0 | 210 |
| M |
0.4* | 0.4* |
9.1* | 36.1* |
9.9 | 1.1 |
4.4 | 6.2 | 0.7 | 6.9 |
-- | 1.8 | 2.9 | -- |
1.1 | 4.7 | 14.4 | 274 |
| |
|
| Base Pair (1061:1077)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* | -- |
45.0* | 1.3* |
0.3 | -- |
12.6 | 0.1 | -- | 0.5 |
-- | -- | 37.9 | -- |
-- | 0.5 | 1.5 | 866 |
| 3 |
-- | -- |
50.6 | -- |
-- | -- |
1.6 | -- | -- | 0.6 |
-- | -- | 46.5 | -- |
-- | -- | 0.6 | 490 |
| B |
-- | -- |
99.2 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 0.8 | 243 |
| A |
-- | -- |
8.3 | -- |
-- | -- |
22.2 | -- | -- | 5.6 |
-- | -- | 63.9 | -- |
-- | -- | -- | 36 |
| C |
-- | -- |
97.0 | -- |
-- | -- |
1.0 | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | 2.0 | -- | 100 |
| E |
-- | -- |
1.9 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 0.5 |
-- | -- | 97.2 | -- |
-- | -- | 0.5 | 211 |
| M |
0.4 | -- |
16.3 | 4.0* |
1.1 | -- |
36.2 | 0.4 | -- | 0.4 |
-- | -- | 37.0* | -- |
-- | 0.7 | 3.7 | 276 |
| |
|
| Base Pair (1065:1073)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | 0.1* |
46.5* | 4.0 |
-- | 0.8 |
0.5 | 20.3* | -- | 24.7 |
0.7 | -- | -- | -- |
-- | 1.2 | 1.3 | 868 |
| 3 |
-- | 0.2* |
53.7* | 5.1 |
-- | -- |
0.8 | 35.8* | -- | 3.7 |
0.6 | -- | -- | -- |
-- | -- | 0.2 | 492 |
| B |
-- | -- |
98.8 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 1.2 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 244 |
| A |
-- | -- |
59.5 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 40.5 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 37 |
| C |
-- | -- |
73.0 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 26.0 |
-- | -- | -- | -- |
-- | 1.0 | -- | 100 |
| E |
-- | 0.5* |
0.5* | 11.8 |
-- | -- |
1.9 | 83.4* | -- | -- |
1.4 | -- | -- | -- |
-- | -- | 0.5 | 211 |
| M |
-- | -- |
24.3 | 3.6* |
-- | 2.5* |
-- | -- | -- | 61.6* |
1.1 | -- | -- | -- |
-- | 3.3 | 3.6 | 276 |
| |
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