23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1209
| Base Pair (1209:1237)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | -- |
16.0 | 0.2 |
0.1 | 0.3* |
8.7 | 0.2* | -- | 2.8 |
-- | 0.3* | 36.1* | -- |
-- | 0.2 | 34.9 | 870 |
| 3 |
-- | -- |
22.5 | 0.2* |
0.2 | 0.6* |
13.0 | -- | -- | 3.8 |
-- | -- | 57.9* | -- |
-- | -- | 1.8 | 494 |
| B |
-- | -- |
29.4 | 0.4* |
-- | -- |
14.0 | -- | -- | -- |
-- | -- | 56.2* | -- |
-- | -- | -- | 265 |
| A |
-- | -- |
2.7 | -- |
-- | -- |
10.8 | -- | -- | 2.7 |
-- | -- | 83.8 | -- |
-- | -- | -- | 37 |
| C |
-- | -- |
1.0 | 1.0* |
-- | -- |
21.0 | -- | -- | -- |
-- | -- | 77.0* | -- |
-- | -- | -- | 100 |
| E |
-- | -- |
17.2 | -- |
0.5 | 1.6* |
12.0 | -- | -- | 10.4 |
-- | -- | 52.6* | -- |
-- | -- | 5.7 | 192 |
| M |
-- | -- |
2.5 | -- |
-- | -- |
2.9 | 0.7* | -- | -- |
-- | 1.1* | 5.4* | -- |
-- | 0.7 | 86.6 | 276 |
| |
|
| Base Pair (1213:1236)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | 0.1 |
0.2 | 0.7 |
0.1* | -- |
2.9 | 0.6 | 65.4* | 1.3* |
-- | -- | -- | 0.3 |
-- | 0.1 | 28.2 | 871 |
| 3 |
-- | 0.2 |
-- | -- |
0.2* | -- |
3.8 | 0.8 | 91.9* | 2.0* |
-- | -- | -- | 0.6 |
-- | -- | 0.4 | 495 |
| B |
-- | -- |
-- | -- |
0.4* | -- |
0.4 | -- | 98.9* | -- |
-- | -- | -- | 0.4 |
-- | -- | -- | 266 |
| A |
-- | -- |
-- | -- |
-- | -- |
-- | -- | 100.0 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 37 |
| C |
-- | -- |
1.0* | -- |
-- | -- |
2.0 | -- | 97.0* | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 100 |
| E |
-- | 0.5 |
-- | -- |
-- | -- |
9.4 | 2.1 | 80.7* | 5.2* |
-- | -- | -- | 1.0 |
-- | -- | 1.0 | 192 |
| M |
-- | -- |
0.4* | 2.2 |
-- | -- |
1.4 | 0.4 | 6.5* | 0.4 |
-- | -- | -- | -- |
-- | 0.4 | 88.4 | 276 |
| |
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