23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1313
| Base Pair (1313:1339)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | 0.2 |
1.2 | 4.2 |
-- | 70.5* |
12.2* | 0.9 | 0.3 | 0.3 |
-- | 0.1* | 0.3 | -- |
-- | 0.8 | 8.8 | 862 |
| 3 |
-- | -- |
-- | -- |
-- | 98.6 |
-- | -- | 0.4 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 1.0 | 486 |
| B |
-- | -- |
-- | -- |
-- | 98.1 |
-- | -- | 0.8 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 1.2 | 264 |
| A |
-- | -- |
-- | -- |
-- | 100.0 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
-- | -- |
2.0 | -- |
-- | 97.0 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | 1.0 | -- | 100 |
| E |
-- | -- |
-- | -- |
-- | 98.9 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 1.2 | 181 |
| M |
-- | 0.7 |
2.9 | 13.0 |
-- | 11.6* |
38.0* | 2.9 | 0.4 | 1.1 |
-- | 0.4* | 1.1 | -- |
-- | 2.2 | 25.8 | 276 |
| |
|
| Base Pair (1320:1332)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.5 | 15.9* |
2.0 | 1.5 |
1.2 | 5.7 |
0.5 | 1.0* | 1.0 | 12.2 |
0.6 | 6.7 | 3.9* | 15.5 |
0.1 | 3.1* | 25.4 | 863 |
| 3 |
5.7 | 26.5* |
0.2 | -- |
2.1 | 9.9 |
-- | -- | -- | 5.1 |
1.0 | 10.9 | 6.4* | 25.3 |
0.2 | 4.9* | 1.8 | 487 |
| B |
-- | 27.9 |
0.4* | -- |
2.6 | 10.9 |
-- | -- | -- | 3.4 |
-- | 14.7* | 1.9 | 28.3* |
-- | 9.1 | 0.8 | 265 |
| A |
-- | 97.6 |
-- | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 2.4 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
-- | 7.0 |
-- | -- |
-- | -- |
-- | -- | 2.0 | 74.0* |
-- | 3.0 | 3.0 | 10.0* |
-- | 1.0* | -- | 100 |
| E |
15.5 | 8.3 |
-- | -- |
1.7 | 10.5 |
-- | -- | -- | 8.3* |
2.8 | 7.7 | 14.4 | 26.5* |
0.6* | -- | 3.9 | 181 |
| M |
0.7* | 0.4* |
5.8* | 4.7* |
-- | 0.4 |
1.4 | 3.3 | 2.5 | 2.2 |
-- | 0.7 | -- | 0.4 |
-- | 0.7 | 76.8 | 276 |
| |
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