23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1429
| Base Pair (1429:1565)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
61.2* | -- |
0.1 | 0.3* |
0.7 | -- |
0.2 | 5.8 | -- | 0.9* |
0.2 | -- | 0.2 | 0.1 |
0.3 | 0.1 | 29.6 | 860 |
| 3 |
88.4* | -- |
0.2 | 0.6* |
1.0 | -- |
0.4 | 7.0 | -- | 1.7* |
-- | -- | 0.4 | 0.2 |
-- | -- | -- | 484 |
| B |
90.5* | -- |
-- | 0.4* |
0.8 | -- |
-- | 8.0 | -- | -- |
-- | -- | -- | 0.4 |
-- | -- | -- | 264 |
| A |
97.6 | -- |
-- | -- |
-- | -- |
-- | 2.4 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
92.0* | -- |
-- | -- |
-- | -- |
-- | 5.0 | -- | -- |
2.0 | -- | -- | -- |
-- | 1.0* | -- | 100 |
| E |
83.2* | -- |
0.6 | 1.1* |
1.7 | -- |
1.1 | 6.7 | -- | 4.5* |
-- | -- | 1.1 | -- |
-- | -- | -- | 179 |
| M |
2.2 | -- |
-- | -- |
0.4* | -- |
-- | 4.0* | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
1.1 | -- | 92.4 | 276 |
| |
| Base Pair (1430:1564)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.1 | -- |
0.5 | 1.2 |
2.1 | 0.3 |
0.9* | 9.3 | 0.1 | 2.8 |
25.1* | 4.2 | -- | 0.2* |
6.3 | 2.2* | 29.7 | 860 |
| 3 |
20.0 | -- |
0.8 | 0.4 |
2.7 | 0.2 |
0.8* | 3.3 | -- | 5.0 |
44.6* | 7.4 | -- | 0.4* |
11.0 | 3.3* | -- | 484 |
| B |
31.8 | -- |
-- | 0.8 |
3.8* | -- |
-- | 5.3 | -- | 0.8 |
47.0* | 10.2 | -- | 0.4 |
-- | -- | -- | 264 |
| A |
19.5 | -- |
-- | -- |
-- | -- |
-- | 2.4 | -- | 4.9 |
65.9 | 7.3 | -- | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
31.0 | -- |
-- | 1.0 |
4.0* | 2.0* |
1.0 | 60.0* | 1.0 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 100 |
| E |
2.8 | -- |
2.2 | -- |
1.7 | 0.6 |
2.2* | 0.6 | -- | 11.2 |
36.3* | 3.4 | -- | 0.6* |
29.6 | 8.9* | -- | 179 |
| M |
0.7* | -- |
-- | 2.5* |
0.4 | -- |
1.1 | 1.4 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
0.4 | 1.1 | 92.4 | 276 |
| |
| Base Pair (1431:1563)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | 12.0* |
0.5 | 23.8* |
0.6 | 7.7 |
0.7 | 3.7 | 16.6 | 1.9 |
0.1 | 0.5 | 0.6* | 0.5 |
0.6* | 0.5 | 29.9 | 860 |
| 3 |
-- | 21.3 |
0.6 | 23.8 |
0.2* | 13.6 |
1.2 | 2.9 | 29.5* | 3.1* |
0.2 | 0.6 | 0.6 | 0.8 |
1.0* | 0.2 | 0.2 | 484 |
| B |
-- | 0.4 |
-- | 38.6 |
0.4 | 10.2 |
-- | 2.3 | 46.6* | -- |
-- | 0.4* | -- | 1.1 |
-- | -- | -- | 264 |
| A |
-- | 51.2* |
-- | 4.9 |
-- | 26.8 |
-- | 14.6* | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | 2.4* | -- | 41 |
| C |
-- | -- |
-- | 79.0 |
3.0 | -- |
-- | 17.0 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 1.0 | 100 |
| E |
-- | 45.3* |
1.7 | 6.1* |
-- | 15.6 |
3.4 | 1.1 | 11.2 | 8.4 |
0.6 | 1.1 | 1.7* | 0.6 |
2.8* | -- | 0.6 | 179 |
| M |
-- | -- |
0.4 | 4.0* |
0.4 | -- |
-- | 0.4 | -- | 0.4 |
-- | 0.4 | 0.7* | -- |
-- | 1.1 | 92.4 | 276 |
| |
| Base Pair (1432:1562)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7 | 0.6 |
4.4* | 2.3 |
33.6* | 2.3 |
0.7 | 0.1 | 2.6* | 0.3 |
0.2* | 0.2 | 0.1 | 11.9 |
0.6 | 8.7 | 30.6 | 860 |
| 3 |
0.8 | 0.8 |
7.6* | 1.4 |
41.3* | 3.9 |
0.8 | 0.2 | 4.3* | 0.4 |
0.4* | 0.2 | 0.2 | 21.1 |
1.0 | 13.8 | 1.4 | 484 |
| B |
0.4 | -- |
9.5* | 2.3 |
67.4* | 0.4 |
-- | -- | -- | 0.8 |
-- | -- | -- | 0.4 |
1.1 | 17.8 | -- | 264 |
| A |
-- | 7.3 |
29.3 | -- |
-- | 43.9 |
-- | -- | -- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 19.5 |
-- | 41 |
| C |
2.0 | -- |
-- | 7.0 |
88.0 | -- |
-- | -- | -- | -- | -- | 1.0 |
-- | -- | -- | 1.0 | 1.0 | 100 |
| E |
1.7 | 0.6 |
-- | 0.6 |
12.3 | -- |
2.2* | 0.6 | 11.7 | -- |
1.1* | 0.6 | 0.6 | 56.4* |
1.1 | 6.7* | 3.9 | 179 |
| M |
-- | 0.4* |
0.4 | 2.2 |
0.4 | 0.4 |
0.7* | -- | 0.4 | 0.4 |
-- | -- | -- | -- |
-- | 2.5* | 92.4 | 276 |
| |
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