23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1688
| Base Pair (1688:1700)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | -- |
71.7 | -- |
-- | -- |
0.4 | -- | -- | 0.4 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 27.5 | 835 |
| 3 |
-- | -- |
99.6 | -- |
-- | -- |
0.2 | -- | -- | 0.2 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 457 |
| B |
-- | -- |
100.0 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 261 |
| A |
-- | -- |
100.0 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
-- | -- |
100.0 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 101 |
| E |
-- | -- |
98.7 | -- |
-- | -- |
0.6 | -- | -- | 0.6 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 155 |
| M |
-- | -- |
15.5 | -- |
-- | -- |
0.7 | -- | -- | 0.7 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 83.0 | 277 |
| |
| Base Pair (1689:1699)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | -- |
-- | 18.8 |
-- | 0.1 |
11.5 | 1.3 | 40.4* | -- |
-- | -- | 0.1* | 0.1 |
-- | 0.1* | 27.5 | 836 |
| 3 |
-- | -- |
-- | 29.3 |
-- | 0.2 |
19.9 | 1.3 | 49.3 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 458 |
| B |
-- | -- |
-- | 26.3 |
-- | -- |
2.7 | -- | 71.0 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 262 |
| A |
-- | -- |
-- | 22.0 |
-- | -- |
-- | -- | 78.0 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
-- | -- |
-- | 5.9 |
-- | -- |
1.0 | -- | 93.1 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 101 |
| E |
-- | -- |
-- | 36.1 |
-- | 0.6* |
54.2* | 3.9 |
5.2 | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- | -- | 155 |
| M |
-- | -- |
-- | 6.1 |
-- | -- |
1.4 | 1.8 | 6.5* | -- |
-- | -- | 0.4* | 0.4 |
-- | 0.4* | 83.0 | 277 |
| |
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