23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1755


Base Pair (1755:1995)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 6.2* -- -- 46.1* -- -- 0.1 17.3 -- -- 0.4 0.5 -- -- 0.5 0.4 28.6809
3 11.6* -- -- 54.2* -- -- 0.2 31.9 -- -- 0.7 0.2 -- -- 0.9 -- 0.2432
B -- -- -- 99.2 -- -- 0.4 -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- --236
A -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --101
E 32.3 -- -- -- -- -- -- 62.6 -- -- 1.9 -- -- -- 2.6 -- 0.6155
M -- -- -- 13.8 -- -- -- 0.7 -- -- -- 1.1 -- -- -- 1.1 83.3276
 
Base Pair (1756:1994)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 40.0 -- -- -- -- -- -- 5.3 -- -- 23.4 -- 0.1 -- 2.5 -- 28.7809
3 53.2 -- -- -- -- -- -- 5.1 -- -- 38.9 -- 0.2 -- 2.1 -- 0.5432
B 79.2 -- -- -- -- -- -- 7.2 -- -- 11.0 -- 0.4 -- 2.1 -- --236
A 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C 89.1 -- -- -- -- -- -- 10.9 -- -- -- -- -- -- -- -- --101
E 1.3 -- -- -- -- -- -- 3.2 -- -- 91.6 -- -- -- 2.6 -- 1.3155
M 1.4 -- -- -- -- -- -- 3.6 -- -- 7.6 -- -- -- 4.0 -- 83.3276
 
Base Pair (1757:1993)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 19.8 17.4 -- -- 0.1* 0.1 -- -- 2.3 -- -- -- 31.5* 28.7809
3 -- -- -- 29.4 31.5 -- -- 0.2* -- -- -- 3.7 -- -- -- 35.2* --432
B -- -- -- 50.4 0.4 -- -- 0.4 -- -- -- 5.5 -- -- -- 43.2 --236
A -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.4 -- -- -- 97.6 --41
C -- -- -- 5.0 1.0 -- -- -- -- -- -- 2.0 -- -- -- 92.1 --101
E -- -- -- 5.2 87.1 -- -- -- -- -- -- 1.3 -- -- -- 6.5 --155
M -- -- -- 10.1 1.4 -- -- -- 0.4 -- -- 0.4 -- -- -- 3.6 84.0276
 
Base Pair (1758:1992)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.2 -- 0.1 -- 5.4 -- -- 13.0 -- -- -- -- 52.5* -- 0.2* 28.4809
3 -- 0.5 -- -- -- 7.6 -- -- 14.8 -- -- -- -- 76.9* -- 0.2* --432
B -- 0.8 -- -- -- 13.1 -- -- 22.9 -- -- -- -- 62.7* -- 0.4* --236
A -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- --41
C -- -- -- -- -- 4.0 -- -- 10.9 -- -- -- -- 84.2 -- -- 1.0101
E -- -- -- -- -- 1.3 -- -- 6.5 -- -- -- -- 92.3 -- -- --155
M -- -- -- 0.4 -- 2.5 -- -- 10.9* -- -- -- -- 2.9 -- 0.4* 83.0276
 
Base Pair (1759:1991)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 63.8 4.0 -- -- 0.1 -- -- -- 1.7 -- -- -- 1.9 28.4807
3 -- -- -- 87.4 7.0 -- -- 0.2 -- -- -- 2.6 -- -- -- 2.1 0.7430
B -- -- -- 97.0 2.6 -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- --234
A -- -- -- 75.6 4.9 -- -- -- -- -- -- 19.5 -- -- -- -- --41
C -- -- -- 91.1 2.0 -- -- -- -- -- -- 2.0 -- -- -- 5.0 --101
E -- -- -- 76.1 14.2 -- -- -- -- -- -- 1.9 -- -- -- 5.8 1.9155
M -- -- -- 17.0 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- 0.4 82.4276
 

Last generated : Fri Jul 20 2001 (9 : 42)