23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1755
Base Pair (1755:1995)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
6.2* |
-- |
-- |
46.1* |
-- |
-- |
0.1 |
17.3 |
-- |
-- |
0.4 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
0.4 |
28.6 | 809 |
3 |
11.6* |
-- |
-- |
54.2* |
-- |
-- |
0.2 |
31.9 |
-- |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.2 | 432 |
B |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
32.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
62.6 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
0.6 | 155 |
M |
-- |
-- |
-- |
13.8 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
83.3 | 276 |
|
Base Pair (1756:1994)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
40.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.3 |
-- |
-- |
23.4 |
-- |
0.1 |
-- |
2.5 |
-- |
28.7 | 809 |
3 |
53.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.1 |
-- |
-- |
38.9 |
-- |
0.2 |
-- |
2.1 |
-- |
0.5 | 432 |
B |
79.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.2 |
-- |
-- |
11.0 |
-- |
0.4 |
-- |
2.1 |
-- |
-- | 236 |
A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
89.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
91.6 |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
1.3 | 155 |
M |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6 |
-- |
-- |
7.6 |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
83.3 | 276 |
|
Base Pair (1757:1993)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
-- |
-- |
19.8 |
17.4 |
-- |
-- |
0.1* |
0.1 |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
31.5* |
28.7 | 809 |
3 |
-- |
-- |
-- |
29.4 |
31.5 |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
3.7 |
-- |
-- |
-- |
35.2* |
-- | 432 |
B |
-- |
-- |
-- |
50.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
-- |
-- |
-- |
43.2 |
-- | 236 |
A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- | 41 |
C |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
92.1 |
-- | 101 |
E |
-- |
-- |
-- |
5.2 |
87.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
6.5 |
-- | 155 |
M |
-- |
-- |
-- |
10.1 |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
3.6 |
84.0 | 276 |
|
Base Pair (1758:1992)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
13.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
52.5* |
-- |
0.2* |
28.4 | 809 |
3 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
7.6 |
-- |
-- |
14.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
76.9* |
-- |
0.2* |
-- | 432 |
B |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
13.1 |
-- |
-- |
22.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
62.7* |
-- |
0.4* |
-- | 236 |
A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
10.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.2 |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
6.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.3 |
-- |
-- |
-- | 155 |
M |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
10.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
0.4* |
83.0 | 276 |
|
Base Pair (1759:1991)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
-- |
-- |
63.8 |
4.0 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
28.4 | 807 |
3 |
-- |
-- |
-- |
87.4 |
7.0 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
0.7 | 430 |
B |
-- |
-- |
-- |
97.0 |
2.6 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 234 |
A |
-- |
-- |
-- |
75.6 |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
-- |
-- |
91.1 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- | 101 |
E |
-- |
-- |
-- |
76.1 |
14.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
5.8 |
1.9 | 155 |
M |
-- |
-- |
-- |
17.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
82.4 | 276 |
|
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