23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1778


Base Pair (1778:1786)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 91.8 -- -- 0.9 1.3 -- -- 4.6 -- -- -- -- 0.1 1.1 0.1843
3 -- -- 89.5 -- -- -- 2.0 -- -- 8.5 -- -- -- -- -- -- --459
B -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --262
A -- -- 80.5 -- -- -- -- -- -- 19.5 -- -- -- -- -- -- --41
C -- -- 98.0 -- -- -- 2.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- --101
E -- -- 74.4 -- -- -- 5.8 -- -- 19.9 -- -- -- -- -- -- --156
M -- -- 93.3 -- -- 2.8 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4 3.2 0.4283
 
Base Pair (1779:1785)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 98.5 -- -- 0.1 -- -- -- 0.1 -- -- -- -- 0.8 0.4 0.1843
3 -- -- 97.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.5 0.7 0.2459
B -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --262
A -- -- 80.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 12.2 7.3 --41
C -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --101
E -- -- 98.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.3 -- 0.6156
M -- -- 99.3 -- -- 0.4 -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- --283
 

Last generated : Fri Jul 20 2001 (9 : 42)